单倍型怎么和性状关联分析

纯合子与杂合子应该区别对待，不能只看AG碱基

你这个情况先不要管纯合杂合了，把GA碱基都进行计数

在分析单核苷酸多态性（SNP）位点时，通常需要考虑杂合子和纯合子的信息。对于每个位点，不仅需要知道单个样本中的碱基，还需要知道杂合子和纯合子的存在情况。

根据您提供的序列示例，共有5个样本，每个样本包含11个位点。对于每个位点，您需要提供每个样本的碱基信息，包括杂合子和纯合子的基因型。

例如，在第一个样本中，如果某个位点是杂合子，应提供两个碱基，如G/A。如果某个位点是纯合子，只需要提供一个碱基，如G。对于每个样本，都应提供准确的基因型信息，以便进行关联分析。

关于SPSS关联分析，确实需要知道每个样本的基因型信息和样本数，以进行适当的分析和统计计算。样本数影响统计学上的可靠性和显著性分析。

总结而言，您需要提供每个样本的准确基因型信息，包括杂合子和纯合子的位点，并确保样本数足够进行关联分析。