知道基因序列，如何寻找或筛选和此基因可能发生相互作用的蛋白因子？

各位大神，最近科研上有个问题难住我了，我们在研究一个蛋白A，现在不清楚到底有什么东西在DNA水平对它进行调控，看过各类文献，上至一二百来分的，下至六七分的，暂时还没看到相关研究，只能确定自噬、凋亡等细胞行为会影响其表达，可是这两者过程中涉及的蛋白千千万，我该如何筛选哪些因子有可能直接作用于蛋白A的DNA上呢？谢谢！