转录表达水平FPKM值在多少以内默认基因是沉默不表达的？有没有文献参考？

通常，FPKM值低于1被认为是低表达或未检测到的转录本。

然而，FPKM的阈值取决于研究中使用的实验条件和生物体的类型。对于某些转录本来说，较低的FPKM值可能仍然表明其功能重要性。因此，建议使用生物学意义和背景知识来解释FPKM值，而不是只依赖于一个固定的阈值。

通常模块中的基因FPKM＜1，是默认不表达的。