提出来的Rna浓度只有200ng/ul,略有降解，反转录出来的cDna作为模板，然后去跑pcr,是不是跑出来的条带都很浅呀

有点浅。引物、模板没问题的话,就加cycle,多扩几轮,就亮了.（一般pcr酶和buffer是没有问题的,除非你反复冻融或者长时间放置室温）如果上一轮扩出来特异性好的话,可以适当降低退火温度.多扩了几轮,退火温度也降低了,但是条带仍然很淡,这时候,基本上就是引物和模板的问题了.你要好好看看引物特异性好不好,dimer亮不亮,（自身发夹一般不会有太大影响）；模板的话,要看看GC含量高不高,模板质量好不好.引物不好只能重新设计.模板不好可以加点DMSO（GC含量高）,或者重新提取.差不多就这几个方面吧~

调整胶的ph和胶的浓度，之后再跑。

200ng/ul的浓度算高了，一般反转录用500-1000ng，100ng都能跑出来很漂亮的条带。应该是你的引物不行。没有用内参做对比吗？

不能完全排除引物和模版的问题，建议换一下试试