用目标蛋白做IP，WB的时候孵Ub，但是目标条带位置没有ladder，该怎么改善条件？

看你的目标蛋白多大，如果比较大可以延长时间试试

建议电泳条件做调整：
1、电压调高要防止电泳温度高导致电泳条带热运扩散；
2、间延
3、琼脂糖浓度降低

你可以加 NEM 抑制 去泛素酶（DUB）的活性，或者干脆用 denaturing IP 去拉目的蛋白，然后检测泛素化。如果真的很难做，可以试试看过表达目的蛋白，再 IP ，当然无论如何也要用 NEM 或者 denaturing IP.