急,我对2-D技术产生动摇了!!!
丁香园论坛
1138
前几天在网上查些水稻蛋白质组学的资料,在日本的一家研究机构(http://gene64.dna.affrc.go.jp/RPD/data/LBY/LBY_extra.html http://gene64.dna.affrc.go.jp/RPD/data/RL01/RL01_list.html?)公布的数据中发现:
同一种蛋白质亚基居然可以出现在同一块凝胶的几个位置,pI和Mw相差甚远,但它们的数据库登陆号又一样!
跑双向只是让蛋白质变性,就没有酶切它们,怎么可能出现这种情况了!
如果是这样的话,要比较差异的话,那得把凝胶上所有的相同亚基找到了,再做对比才有说服力,不然很多论文上的东西我不得不怀疑其真实性了!
谁能解释一下!不然我对2-D技术就没有丝毫信心了!再做那纯粹是在烧钱!
Spot pI MW Accession No. Homologous Protein
214 5.06 26.32 - 11094301 ascorbate peroxidase
215 5.20 26.24 - 11094301 ascorbate peroxidase
216 4.93 26.14 - 11094301 ascorbate peroxidase
282 5.92 15.85 - 132105 RuBisCO small subunit
283 6.70 15.83 - 132105 RuBisCO small subunit
284 6.00 15.79 - 132105 RuBisCO small subunit
285 6.57 15.77 - 132105 RuBisCO small subunit
286 5.35 15.74 - 132105 RuBisCO small subunit
287 6.81 15.74 - 132105 RuBisCO small subunit
288 4.66 15.47 - 132105 RuBisCO small subunit
202 6.19 28.30 - 11466795 RuBisCO large subunit
200 6.03 28.62 - 11466795 RuBisCO large subunit
195 6.49 29.25 - 11466795 RuBisCO large subunit
183 6.67 30.83 - 11466795 RuBisCO large subunit
101 6.79 43.05 - 11466795 RuBisCO large subunit
102 7.26 42.94 - 11466795 RuBisCO large subunit
同一种蛋白质亚基居然可以出现在同一块凝胶的几个位置,pI和Mw相差甚远,但它们的数据库登陆号又一样!
跑双向只是让蛋白质变性,就没有酶切它们,怎么可能出现这种情况了!
如果是这样的话,要比较差异的话,那得把凝胶上所有的相同亚基找到了,再做对比才有说服力,不然很多论文上的东西我不得不怀疑其真实性了!
谁能解释一下!不然我对2-D技术就没有丝毫信心了!再做那纯粹是在烧钱!
Spot pI MW Accession No. Homologous Protein
214 5.06 26.32 - 11094301 ascorbate peroxidase
215 5.20 26.24 - 11094301 ascorbate peroxidase
216 4.93 26.14 - 11094301 ascorbate peroxidase
282 5.92 15.85 - 132105 RuBisCO small subunit
283 6.70 15.83 - 132105 RuBisCO small subunit
284 6.00 15.79 - 132105 RuBisCO small subunit
285 6.57 15.77 - 132105 RuBisCO small subunit
286 5.35 15.74 - 132105 RuBisCO small subunit
287 6.81 15.74 - 132105 RuBisCO small subunit
288 4.66 15.47 - 132105 RuBisCO small subunit
202 6.19 28.30 - 11466795 RuBisCO large subunit
200 6.03 28.62 - 11466795 RuBisCO large subunit
195 6.49 29.25 - 11466795 RuBisCO large subunit
183 6.67 30.83 - 11466795 RuBisCO large subunit
101 6.79 43.05 - 11466795 RuBisCO large subunit
102 7.26 42.94 - 11466795 RuBisCO large subunit