【求助】如何预测一个TF可以调控哪些microRNA的表达？
丁香园论坛
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已知一个microRNA，可以在ucsc上查找已知的TF结合位点，也可预测其潜在的TF结合位点。
反过来，已知一个TF，如NFAT，怎样预测它可以调控哪些microRNA的表达？
在此求助各位高手解答，多谢！
反过来，已知一个TF，如NFAT，怎样预测它可以调控哪些microRNA的表达？
在此求助各位高手解答，多谢！
我不小心发了两个帖子，在生物信息学里面发的那个似乎人气稍多一点儿
http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=73&id=16632525&sty=1&tpg=1&age=0
http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=73&id=16632525&sty=1&tpg=1&age=0
ChIP-on-ChIP or ChIP-seq to sceen,
Y1H to confirm.
Y1H to confirm.
bigbang_0_0 wrote:
ChIP-on-ChIP or ChIP-seq to sceen,
Y1H to confirm.
谢谢！
实验的方法固然稳定一些，但是我想看一个microRNA cluster受哪些TF的调控用，直接用这种方法做工作量大，花费高，不现实。
我想软件预测出几个TF所调控的所有miR，然后再对比挑选出候选的TF，在用ChIP、luciferase等验证
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