microRNA在一个肿瘤中的表达情况

dxy_l1y15rd2

2023-01-21

1.我想查microRNA-145在黑色素瘤中的表达是上调还是下调有什么数据库能查到吗？

2.我想找microRNA的靶基因，怎么做？这也有数据库吗？我看文献里用了几个数据库，我还是想再问一下各位大佬～

dxyc42u

2023-01-24

有帮助

推荐这几个数据库：miRBase，DIANA-TarBase v8.0，YM500

汤姆卜丽波

2023-01-23

有帮助

看表达的话GEPIA2，CCLE，TIMER都可以

loveliufudan

2023-01-22

有帮助

可以在NCBI的Gene Expression Omnibus (GEO)数据库中查询microRNA-145在黑色素瘤中的表达情况。另外，还可以在Oncomine数据库中查询。

可以在以下数据库中查询microRNA的靶基因：

TargetScan: http://www.targetscan.org/

miRDB: http://mirdb.org/

miRTarBase: http://mirtarbase.mbc.nctu.edu.tw/

miRWalk: http://zmf.umm.uni-heidelberg.de/apps/zmf/mirwalk2/

miRTarPred: http://mirtarpred.mbc.nctu.edu.tw/

miRecords: http://mirecords.biolead.org/

这些数据库都提供了microRNA靶基因的相关信息, 可以根据需要选择使用。