配子体不亲和性 gametophytic incompatibility
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同型不亲和性（自身不亲和性）的一种类型，当具有不亲和基因（ S基因）的花粉和雌蕊所带的不亲和基因相同时，花粉管的伸长就受到阻碍而防止受精。例如产生花粉的亲本植株的基因型为 S1 S2 ，而雌蕊的基因型为 S1 S3 ，则含有 S1 的花粉由于不亲和性，它的花粉管在花柱内的伸长受到阻碍，而含 S2 基因的花粉由于亲和性所以能够正常伸长。花粉所表现的这种性质是由花粉的基因型、也就是由配子体的基因型所决定的，这种现象称为配子体不亲和性，柳叶菜科（ Onagraceae）、豆科、茄科等植物已知有许多这种例子。
