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Chemicon公司的CpGenome DNA Modification Kit 的protocol修正

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904

我用了快4个月这个试剂盒了,下面是一些总结出来的经验,我现在诱变每

次都很成功了,呵呵:)

1. 我溶NaOH的水PH值大概在6.5左右,所以我每次调Reagent I的时候3MNaO0H

基本都要加150uL左右。

2. 解链时用50度水浴15分钟。

3. 加入Reagent I后,50度水浴16小时。

4. 加入Reagent II和III后,室温孵育10分钟

5. 第一次离心用9000 rpm 5分钟。

6. 70%乙醇清洗3次,每次9000rpm 1 分钟,最后一次13000rpm2min。

7. 加入20mM NaOH/90%EtOH后,反映5分钟。

8. 不要去掉20mM NaOH/90%EtOH,直接加入90%乙醇后离心,9000rpm 1min

9. 90%乙醇清洗2次,每次9000 rpm 1 min,最后一次13000rpm 3min

10. PH 7.5 TE buffer 65度 溶解 15 min

PS: 如果发现PCR结果中M,U,W都有产物,则提高些退火温度,因为毕竟这几对引物都只由几次位点甚至只有一个位点的差异,故非特异结合的可能性很大。

另外,每次PCR前一定把处理的DNA离心一下,因为会有残留的小珠,即Reagent III,它会影响PCR的结果。

还有问题,欢迎发帖一起讨论:)

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