请教引物设计方面的问题,谢谢大家来讨论
丁香园论坛
791
我在ncbi的gene中找我要的基因cDNA,没有找到大鼠的基因,请问我可否用小鼠的基因或人类的基因来代替,如果代替的话,会出现什么问题?我把该基因的CDs序列放上来,能否帮我看看引物设计成什么比较好。
atggaac tgaaaatctg acgacatctc tcattaataa
601 cacgtgtcat gacacaattg atgaattccg aaatcaagta tactccacta tgtattctgt
661 gatctctgtt gtgggtttct ttggcaatag ctttgtgctc tatgtcctca taaaaacata
721 ccatgagaaa tcagccttcc aagtatacat gattaatcta gccatagcag atctactctg
781 tgtatgtaca ttgcctctcc gtgtggtcta ttatgttcac aaaggcaagt ggctctttgg
841 tgactttttg tgccgcctca ccacctatgc cttgtacgtt aacctctatt gtagcatctt
901 ctttatgaca gccatgagct ttttccggtg tgttgcaatt gtctttccag tccagaacat
961 taatttggtt acacagaaaa aagccaggtt cgtttgcatt ggaatttgga tttttgtgat
1021 tttgacaagt tctccctttt taatgtacaa atcttaccaa gatgagaaaa acaatactaa
1081 atgctttgag cctccacaga acaatcaagc taaaaaatac gttttgatct tgcattatgt
1141 gtcattattc tttggtttca tcatcccttt tgtcaccata attgtctgtt acacaatgat
1201 cattctgacc ttactaaaaa atacaatgaa gaaaaacatg ccaagtcgta ggaaggctat
1261 agggatgatc atagttgtga cagctgcctt tttagtgagc ttcatgccat atcatattca
1321 acgaactatc caccttcacc ttttacacag tgaaactaga ccctgtgatt ctgtccttag
1381 gatgcagaag tcagtggtca taaccttatc tctagctgca tcaaattgtt gctttgatcc
1441 tctgctatat ttcttttcag gtggaaactt taggagaagg ctatctacat ttagaaagca
1501 ttctttgtcc agtatgactt atgtacccaa gaagaaagct tccttgccag aaaaaggaga
1561 agaaatatgt aacgaataa
atggaac tgaaaatctg acgacatctc tcattaataa
601 cacgtgtcat gacacaattg atgaattccg aaatcaagta tactccacta tgtattctgt
661 gatctctgtt gtgggtttct ttggcaatag ctttgtgctc tatgtcctca taaaaacata
721 ccatgagaaa tcagccttcc aagtatacat gattaatcta gccatagcag atctactctg
781 tgtatgtaca ttgcctctcc gtgtggtcta ttatgttcac aaaggcaagt ggctctttgg
841 tgactttttg tgccgcctca ccacctatgc cttgtacgtt aacctctatt gtagcatctt
901 ctttatgaca gccatgagct ttttccggtg tgttgcaatt gtctttccag tccagaacat
961 taatttggtt acacagaaaa aagccaggtt cgtttgcatt ggaatttgga tttttgtgat
1021 tttgacaagt tctccctttt taatgtacaa atcttaccaa gatgagaaaa acaatactaa
1081 atgctttgag cctccacaga acaatcaagc taaaaaatac gttttgatct tgcattatgt
1141 gtcattattc tttggtttca tcatcccttt tgtcaccata attgtctgtt acacaatgat
1201 cattctgacc ttactaaaaa atacaatgaa gaaaaacatg ccaagtcgta ggaaggctat
1261 agggatgatc atagttgtga cagctgcctt tttagtgagc ttcatgccat atcatattca
1321 acgaactatc caccttcacc ttttacacag tgaaactaga ccctgtgatt ctgtccttag
1381 gatgcagaag tcagtggtca taaccttatc tctagctgca tcaaattgtt gctttgatcc
1441 tctgctatat ttcttttcag gtggaaactt taggagaagg ctatctacat ttagaaagca
1501 ttctttgtcc agtatgactt atgtacccaa gaagaaagct tccttgccag aaaaaggaga
1561 agaaatatgt aacgaataa