【求助】allele specific expression (ASE) assay

丁香园论坛2015-08-21

2028

youyoubantang

想请教各位大侠，等位基因特异性表达分析：allele specific expression (ASE) assay 到底是什么，他的原理及操作步骤是怎样的，特别是原理，一直搞不明白
还有就是他怎样验证cis-eQTL 的真实性

shilei5794749

DOI 10.1016/j.cell.2010.09.049 看这篇文章！讲 long-noncoding RNAs 中 Jpx 调节 x chromosome inactivation 的。里面有 allele specific expression (ASE) assay的做法，以及怎样配合FISH技术验证cis/trans-eQTL。估计楼主用不着这么复杂，直接找转录组中的SNP，对同一区域包含SNP的转录片段Taqman探针荧光定量即可。

youyoubantang

您好，谢谢你的回复，能不能把你说的DOI 10.1016/j.cell.2010.09.049 这篇文章发我看看，我是需要用ASE来验证cis-eQTL的真实性，不知您是否能给我讲讲?是不是根据等位基因的表达量来判断，如果等位基因表达量偏离1:1，就是cis-eQTL，如果，等位基因表达量是1:1，那就是tran-eQTL？？

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