【求助】请教关于转录起始位点的序列特征
丁香园论坛
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在网上查到转录起始位点通常为一个嘌呤,就是说不是一个A就是一个G。而记着好像分子生物学上曾经给过序列特征,是ANTA(G)....,有确切了解这个序列特征的同学或者老师吗?请解答一下!
转录起始位点是指合成RNA的第一个核苷酸所对应的模板序列,RNA的第一位即5'-端总是GTP或ATP,GTP更常见。那么转录起始位点应该是C或T序列,但是不是所有的C或T是起始位点,一般是存在于特征性序列中的C或T才是,比如你提到的ANTA(G)等。
现在有个疑问。网上有个关于用NCBI查启动子的方法,用那个方法查出的转录起始位点多数为A(g),少数是C(T),现在怎么能知道是不是不准呢?NCBI给出的都应该是正义链吧?
that is so-called initiator. Not all promoter has it.
check this:
http://en.wikipedia.org/wiki/Initiator_element
check this:
http://en.wikipedia.org/wiki/Initiator_element
那这种so-called initiator,如果是A(g),而不是C(T),是否一定不是转录起始位点了?现在就是没有报道基因的转录起始位点。
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