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酵母基因组的抽提方法

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问:我电转化的酵母抽基因组后做PCR鉴定,本就有颜色筛选的,应该成功率很大的啊,可是我鉴定了无数个克隆,就是拉不出PCR来。难道抽基因组的方法很关键吗?有的文献甚至用菌落做PCR,是不是骗人的啊?

我是用蜗牛酶(鼎国)破壁,再冻融几次,然后用SDS做用一会后加入蛋白酶K,数小时后酚氯仿作用,离心取上清后沉淀DNA,溶解后加RNA作用后,再酚氯仿抽提一次。不知是否有问题?谁有好的方法?

答:如果做地是短片断PCR(小于1.5kb),用菌落PCR完全可以,而且在筛选时可省去许多时间,用抽基因组做PCR鉴定,太耗时了。我给你一个做菌落PCR的protocol,我是用这种方法做的,很好用!具体方法:

①take cells from a fresh plate (it doesn't work as well if the plate comes out of the fridge)

②with a small tip resuspend a little bit of a yeast colony (not the whole colony) in 25 µl PCR mastermix

③run PCR with the following parameters:

1、 95 °C, 5 min

2.、95 °C, 30 sec.

3、50-55 °C, 30 sec.

4、72 °C, 1min/kb

5、72 °C, 3 min

run 35 cycles (steps 2 to 4)

④load the whole reaction on agarose gel

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