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接受肝移植的病人应该是患有不可逆性急、慢性肝脏疾病的病人，并且没有其他有效的治疗方法，无肝移植的禁忌症。病人和其家属必须理解手术的重大意义，愿意面对术中和术后可能遇到的许多困难，能够接受终身的免疫抑制剂治疗，并且没有经济上的问题。
肝移植最主要的适应症是各种进展性慢性肝病。丙型肝炎、酒精性肝硬化和慢性胆汁郁积性肝病占肝移植病因的2/3左右。越来越多的急性和亚急性肝功能衰竭者、胆道闭锁症患者，以及遗传代谢性肝病患者也开始接受肝移植，而因肿瘤行肝移植的病人所占比例则在减少。有争议的适应症包括酒精性肝病、慢性乙型肝炎，以及不能切除的肝脏恶性肿瘤。
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