Cot分析 Cot analysis

在两条具有互补碱基顺序的两个单链<font>DNA</font> <font>之间，根据重组为双链分子速度的分析来确定</font> <font>DNA</font> <font>碱基排列的复杂程度和排列折返频度，这种分析方法称为</font> <font>Cot</font> <font>分析。其反应速度与</font> <font>DNA</font> <font>的浓度成正比。若</font> <font>DNA</font> <font>样品中碱基顺序有重复，则重组速度就与重复频率成正比地增加。</font> <font>1968</font> <font>年</font> <font>R.J.Britten</font> <font>和</font> <font>D.E.Kohne</font> <font>按此原理，作为对含大量各种碱基重复序列的高等生物</font> <font>DNA</font> <font>结构分析的一种手段，提出了</font> <font>Cot</font> <font>分析。设</font> <font>DNA</font> <font>浓度为</font> <font>C</font> <font>，反应时间为</font> <font>t</font> <font>，速度常数为</font> <font>K</font> <font>，</font> <font>DNA</font> <font>链的重组速度</font> <font>v</font> <font>，可用如下的二次函数表示，即：</font> <font>v=dC/dt=-KC</font> <font>² </font> <font>。设</font> <font>DNA</font> <font>的最初浓度为</font> <font>C</font> <font>₀ </font> <font>，进行积分就成为：</font> <font>C/C</font> <font>₀ </font> <font>=1/</font> <font>（</font> <font>1 KC</font> <font>₀ </font> <font>t</font> <font>），（</font> <font>C</font> <font>₀ </font> <font>-C</font> <font>）</font> <font>/C=KC</font> <font>₀ </font> <font>t</font> <font>，即在一定时间后，形成双链</font> <font>DNA</font> <font>的量</font> <font>C</font> <font>₀ </font> <font>-C</font> <font>和残留的单链</font> <font>DNA</font> <font>的量</font> <font>C</font> <font>之比与</font> <font>C</font> <font>₀ </font> <font>×</font> <font>t</font> <font>成正比。将</font> <font>C</font> <font>₀ </font> <font>×</font> <font>t</font> <font>作为参数，就称为</font> <font>Cot</font> <font>，将</font> <font>Cot</font> <font>的对数作为横坐标，</font> <font>C/C</font> <font>₀ </font> <font>作为纵坐标的</font> <font>Cot</font> <font>曲线，对</font> <font>DNA</font> <font>样品中碱基顺序组成的分析，特别是对重复顺序的分析是很有成效的。</font>