纯合克隆筛选
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纯合克隆筛选
1. 融化杂合突变 ES 细胞, ES/LIF 培养液培养,每 2 ~ 3 天传代,实验开始把细胞接种到三个 100mm 铺有凝胶碟皿中,每皿接种 1 ~ 2 × 106 细胞。为筛选需用一个以上的 ES 杂合突变细胞系,因不同细胞系的转化效率不全相同,另外对检测细胞表型也需如此。
2. 每皿细胞分别加入 1.0 ~ 2.0mg/ml 的 G4178 (终浓度, pH7.4 );应用 neo 和 hyg 基因作为筛选标记效果都很好,用 hyg 时浓度为 1.0 ~ 2.0mg/ml 的 hygromycin- β的 ES/LIF 培养液。
3. 培养细胞 7 ~ 10 天,每天换液,仍用含有适当浓度 G418 的 ES/LIF 培养液,培养至出现很多单个克隆为止;如细胞已长满而未出现单个克隆时,应重复 2 ,并加大 G418 浓度。
4. 按前述杂合突变所述 15 ~ 21 步筛选法进行克隆筛选;在出现有杂交片段表示在纯合突变细胞中不存在无改变的靶基因。典型情况下,应有 50 %为纯合的,这是因为此过程是随机的,个别杂合克隆也可能产生纯合克隆。
5. 进行 Northern 分析 mRNA ,或用免疫吸印分析蛋白质,以确定靶基因是否表达。应是抑活的,即不表达,也不应有正常 mRNA 或蛋白质。