组织印迹的Northern杂交
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组织印迹的 Northern 杂交
1 )硝酸纤维素膜或尼龙膜上的组织印迹
1. 在塑料板上放置两层 Whatman 1 号滤纸,在滤纸上方放上一张普通纸,然后铺上一层尼龙膜。
2. 用双面刀片从植物组织如大豆的茎上切取一块切片(厚度约为 1mm )。如果组织表面是湿的,则在 Kimwipes 纸上轻轻吸干或先用蒸馏水洗涤几秒钟然后再用 Kimwipes 纸吸干。用镊子将组织切片转移到硝酸纤维素膜上,注意一旦将切片放置在膜上就不得再移动切片。在切片上放置 4 层 Kimwipes 纸,用手指轻压 15 ~ 20 秒,用镊子小心拿开纸和组织切片。组织切片经甲苯酸蓝染色后观察其解剖结果。
3. 80 ℃真空烘烤留有组织印迹的尼龙膜 2 小时或用 UV cross-linker 在紫外光下照射尼龙膜。
4. 将留有印迹的膜面向下,放入载玻片上的一滴甲苯酸蓝溶液中,对组织切片进行染色。 2 ~ 3 分钟后,吸干多余的染料,用间接照明立刻照相。将载玻片翻转,透过玻璃拍摄被染色的组织切片。在切片上粘上几张纸片以免组织切片接触显微镜。
2 )用 35 S -标记的 RNA 探针检测植物印迹中的 mRNA
1. 在 Seal-A-MealTM 塑料带中倒入 30 ~ 40ml 洗涤溶液 I , 65 ℃清洗留有印迹的尼龙膜 4 小时。
2. 将膜放入 20ml 杂交溶液中, 68 ℃预杂交 4 小时。
3. 将膜和用 35 S- 标记的 RNA 放入 10ml 杂交溶液中, 68 ℃杂交 20 小时。
4. 在 100ml 洗涤溶液Ⅱ中 42 ℃清洗尼龙膜 20 分钟,换上新鲜洗涤溶液,重复清洗 2 次。
5. 用 100ml 洗涤溶液Ⅲ在适当的温度下( 60 ~ 68 ℃)。用手提式微型检测器监控尼龙膜上剩余的放射性。清洗完毕后,有义 RNA 探针杂交的膜不再有放射性信号,但用反义 RNA 探针杂交的尼龙膜一般具有可检测的放射性信号。该信号的强度依赖于目的 RNA 的丰度。室温下用 0.2 × SSC 对尼龙膜进行简单清洗,在空气中晾干。
洗涤缓冲液Ⅲ:
0.1 mol/L Tris-HCl(pH8.0)
1 mmol/L EDTA
6. 将膜暴露在 X- 射线胶卷或 Kodak T-max 400 胶卷下进行放射自显影。用水平力如一小叠书使膜和胶卷保持良好的接触。一般来说,利用 T-max 400 胶卷比 X- 射线胶卷具有更高的分辨率。放射自显影的时间依赖于放射性信号的强弱,通常从 4 小时到 4 天。
7. 在 X- 射线处理器中对 X- 射线胶卷显影。把 T-max400 胶卷浸入 Kodak T-max 显影液 I 中显影 1 分钟,将底片转移到显影终止盘中 30 秒后浸入 Kodak 快速定影液中 5 分钟,然后用蒸馏水洗涤 5 分钟。
8. 在解剖显微镜下观察组织印迹中 mRNA 的位置。用 Kodak Technical Pan Film 2415 胶卷拍摄 mRNA 的定位模式,然后和用苯甲酸蓝染色的组织切片解剖结果比较。