细胞凋亡检测:生化特征的检测方法
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根据调亡的生化特征的检测方法
一、琼脂糖凝胶电泳
1 )常规的琼脂糖凝胶电泳
方法一:
1. 收集细胞( 5 × 106 ) 1000r/min ,离心 5min ,去上清。
2. PBS 洗一次, 1000r/min ,离心 5min ,去上清。
3. 加细胞核裂解液 500 μ l 重悬细胞, 50 ℃水浴, 3 ~ 5h ,不时振摇或 37 ℃过夜。
4. 加 0.5ml 平衡酚抽提,上下颠倒几次混匀, 6000r/min ,离心 5min 。
5. 上清移至另一 Ep 管,加 0.5ml 氯仿:异戊醇抽提,上下颠倒几次混匀, 6000r/min ,离心 5min 。
6. 上清移至另一 Ep 管,加 50 μ l 的 3mol/L 乙酸钠和 2ml 预冷无水乙醇,上下颠倒几次混匀,可见絮状白色沉淀物。
7. 置液氮 5 ~ 10min , 12 000r/min 离心 10min 沉淀 DNA ,去上清,真空抽干或风扇下吹干残存液体。
8. 加 50 ~ 100 μ l TE 缓冲液,另加 5 μ l RNase , 37 ℃水浴 30min 。
9. 取 20 μ l 加上样缓冲液 2 ~ 5 μ l , 1 %琼脂糖凝胶电泳(电压 50V , 1.5 ~ 2h ), UV 下观察。
方法二:
1. 离心收集细胞( 5 × 106 ), PBS (无 Ca2 + 和 Mg2 + )洗 1 ~ 2 次。
2. 0.5ml TBE 溶液重悬, 37 ℃孵育 30min 。
3. 1mg/ml 蛋白酶 K 37 ℃处理 30min 。
4. 加入上样缓冲液 0.1ml 。
5. 25 μ l 上样, 1.5 %的琼脂糖凝胶上电泳, 2V/cm 6h 。
方法三:
1. 收集细胞悬液( 106 细胞),低速离心( 1000r/min ,离心 5min )。
2. 去上清,沉淀加 0.4ml 低渗缓冲液作用 1h 。
3. 13 000r/min ,离心 10min ,将上清转移至另一 Eppendorf 管中,加等量 50 %异丙醇和 0.5mol/L NaCl 混匀,置液氮 5min 。
4. 12 000r/min ,离心 10min ,弃上清,沉淀真空抽干。
5. 加 TE 100 μ l , 65 ℃加热 10min ,取 20 μ l ,加 1 ~ 2 μ l 上样缓冲液,电泳观察。
方法四:
1. 收集细胞, 1000r/min 离心 5min ,去上清。
2. 用冰预冷的 70 %乙醇固定,可长期保存于- 20 ℃冰箱。
3. 1000r/min 离心 5min ,去除固定液,用约 0.5ml 的 PBS 重悬细胞。
4. 转入 Eppendorf 管中,同法离心,去上清。
5. 细胞用 40 μ l PC 缓冲液重悬,室温 30 ~ 60min 。
6. 1000r/min 离心 5min ,吸上清于新的 Eppendorf 管中,真空浓缩 15min 。
7. 加入 0.25 % NP-40 溶液 3 μ l , 1mg/ml RNase A 溶液 3 μ l , 37 ℃, 30min 。
8. 加入 3 μ l 蛋白酶 K , 37 ℃, 30min 。
9. 加入 12 μ l 样品稀释液,含溴化乙锭的 1.5 %琼脂糖电泳,观察。
2 )琼脂糖凝胶电泳的定量检测
简易末端标记法
1. 按常规提取细胞 DNA 。
2. 在 0.5ml 的 EP 管中加入细胞 DNA ,反应体系如下:细胞 DNA 0.5 ~ 1.0 μ g , 10 ×缓冲液 2 μ l , 32 P-dATP (或 -dCTP ) 0.5 μ Ci , Klenow 聚合酶 5U ,双蒸水加至 20 μ l 。
3. 混匀后稍加离心,室温反应 30min 。
4. 加 1 μ l 0.5mol EDTA 终止反应。
5. 常规酚 / 氯仿 / 异戊醇抽提 1 次,无水乙醇沉淀 DNA ,真空抽干。
6. 溶于 20 μ l 的 TE 缓冲液中。
7. 取标记 DNA 在 1.8 %琼脂糖凝胶上点样, 50V 电泳约 2h 。
8. 电泳后的凝集置滤纸上烘干,进行放射自显影。
5’ 末端 32 P 标记法
细胞 DNA 的提取
1. 细胞悬液离心后,沉淀加消化缓冲液 0.5ml , 50 ℃ 3 ~ 5h ,或 37 ℃过夜。
2. 用等体积的酚:氯仿:异戊醇抽提细胞裂解液。
3. 将水相转移至新的试管,加入 150mmol/L 乙酸钠和 10mmol/L 氯化镁。
4. 加入 2 倍体积的预冷无水乙醇,置液氮 5min 或- 20 ℃ 12h 。
5. 12 000r/min 离心沉淀 DNA , 70 %乙醇洗 1 次后,真空抽干。
6. 溶于 20 μ l 的 TE 缓冲液中。
7. 加入终浓度为 10 μ g/ml RNase , 37 ℃, 30min 。
8. 同法用等体积酚:氯仿:异戊醇抽提,乙醇沉淀,真空抽干。
9. 溶液 20 μ l 的 TE 缓冲液中,- 20 ℃ 保存备用。 DNA 含量测定:用 260nm 波长紫外分光光度计:吸光单位为 20 时约为 1mg/ml DNA 。
DNA 5’ 末端脱磷酸
1. 取纯化的细胞 DNA 10 μ g ,然后加入: 10 × CIP 2 μ l ( 1U ),双蒸水加至 50 μ l 。
2. 37 ℃水浴 2h 。
3. 90 ℃水浴 5min 以灭活 CIP 。
4. 用等体积酚:氯仿:异戊醇抽提,乙醇沉淀,真空抽干。
DNA 5’ 末端 32 P 标记
1. 将脱磷酸样品 DNA 置冰浴上,再加双蒸水 10 μ l , 10 ×缓冲液 2 μ l , T4 多核苷酸激酶 10U , 32 P-ATP 740kBq ( 20 μ Ci ),双蒸水加至 20 μ l 。
2. 混合后, 37 ℃水浴 60min 。
3. 加入 1 μ l 的 0.5mol/L EDTA , 90 ℃灭活 5min 。
观测
1. 取一定量的标记 DNA 稀释后在 1.8 %琼脂糖凝胶上点样, 50V 电泳约 2h 。
2. 电泳后的凝胶置滤纸上烘干,进行放射自显影。
3. 含 32 P 标记 DNA 电泳干凝胶进行同位素液闪测定,计算放射活性。
二、原位末端标记技术
1 ) DNA 聚合酶或 Klenow 大片段介导的原位缺口平移( ISNT )
1. 切片常规脱蜡,梯度乙醇复水化。
2. 将切片组织浸入 2 × SSC 液中, 80 ℃, 20min ,然后蒸馏水冲尽。
3. 0.5 %胃蛋白酶( pH2.0 ) 37 ℃消化 0 ~ 20min , PBS 洗尽。
4. 用滤纸擦干组织块周边液体放入湿盒组织切片上滴加缓冲液 A , 5min 。缓冲液 A : 50mmol/L Tris-HCl, 5mmol/L MgCl2 , 10mmol/L β - 巯基乙醇, 0.005 % BSA , pH7.5 。
5. 弃去缓冲液 A ,滴加标记液约 50 μ l , 25 ℃温育 1h 。标记反应液: 0.005mmol/L dNTP, 0.005mol/L biotin-16-dUTP, 25U/ml Klenow 大片段。
6. PBS 漂洗 2 次,各 3min 。
7. 内源酶阻断剂阻断 15min 。
8. PBS 洗 2 次,各 3min 。
9. 滴加 HRP-avidin 覆盖组织,室温下 30min 。
10. PBS 洗 2 次,各 3min 。
11. DAB-H2 O2 显色约 5min 。
12. 流水冲洗后,苏木素复染 1min 。常规脱水,透明,封片。
13. 阴性对照片在第 5 步改加不含 Klenow 的标记液,余同。
2 ) TdT 介导的 dUTP 缺口末端标记技术( TUNEL )
1. 切片常规脱蜡,复水,后续过程在湿盒内进行。
2. 3 %的 H2 O2 阻断内源性辣根过氧化物酶 30min 。
3. 0.15mol/L 的 PBS 洗 2 次,每次 5min 。
4. 切片浸泡在 2 × SSC 80 ℃ 20min 。
5. 0.15mol/L 的 PBS 洗 2 次,每次 5min 。
6. 蛋白酶 K 或胃蛋白酶消化 0 ~ 20min 。
7. 0.15mol/L 的 PBS 洗 2 次,每次 5min 。
8. TdT 缓冲液孵育 10min 。
9. TdT 反应液 37 ℃孵育 1h 。
10. 切片浸泡在 2 × SSC 溶液 10min ,以终止反应。
11. 0.15mol/L 的 PBS 洗 2 次,每次 5min 。
12. 链卵白素标记的辣根过氧化物酶孵育 30min 。
13. 0.15mol/L 的 PBS 洗 2 次,每次 5min 。
14. 0.04 %的 DAB 显色 5 ~ 10min ,镜下控制时间。
15. 苏木素复染 3 ~ 5min ,常规复水,透明和封片。