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碱裂解法大量提取质粒(500mL菌液)

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碱裂解法 大量提取质粒(500mL菌液)

1、取培养至对数生长后期(一般培养12~16小时)的含待提质粒的细菌 培养液于离心杯中,配平,4℃下4000rpm离心15min,弃上清,然后将离心管倒置于干净的约纸上使上清液全部流尽。

2、向盛有细菌 沉淀物的离心管中加入20mL冰冷的溶液Ⅰ,重悬沉淀(先加5mL溶液Ⅰ,用干净的玻璃棒搅拌均匀后,再加剩下的部分)。

3、加入40mL冰冷的新配制的溶液Ⅱ,盖紧瓶盖,缓缓地颠倒离心数次,使离心管内溶物充分混匀。此步需注意:混匀过程不可用力过猛,否则容易导致基因组 DNA污染。正确的方法是:缓缓地颠倒离心管数次或双手持管使其轴线水平,并使管沿轴线旋转,直到内容物粘稠有“拉丝”为止。

4、加30mL用冰预冷的溶液Ⅲ,盖紧瓶盖,摇动离心管数次以混匀内容物,冰上放置15 min,此时应形成白色絮状沉淀。

5、配平,4℃下4400rpm离心15min。注意:如果第4步混合不均匀,则不能形成致密的沉淀,下步取上清液则应用纱布过滤。

6、用纱布过滤取上清液,加入0.6倍体积异丙醇,-20℃静止20min使质粒 沉淀。

7、配平,4℃下8500rpm离心10min,弃上清,倒置于吸水纸上。沉淀用数mL70%乙醇洗,干燥后,用10mL的TE溶解质粒沉淀。

8、加等体积冰预冷5mol/L的LiCl溶液,混匀后,4℃下放置10min。此步的目的是使大片段的RNA和大分子的蛋白质沉淀。

9、配平,4℃下8500rpm离心10min,保留上清,加2倍的无水乙醇,-20℃静置20min使质粒沉淀。

10、同7步,并将质粒溶液中加入20μL的RNaseA(终浓度20μg/mL),37℃放置0.5-1h。

11、分别加入等体积萃取液(酚:氯仿:异戊醇=25:24:1),振荡混匀,配平,4℃下8500rpm离心10 min。

12、取上层水相至新的EP管中,加入等体积氯仿/异戊醇(24:1),振荡混匀,配平,4℃下8500rpm离心10 min。

13、取上层水相于新的EP管中。注意:13和14步对提高提取的质量和产率比较重要。

14、加入等体积的PEG-NaCl溶液,轻轻混匀,室温静置30min(大于10min)。

15、配平,4℃下8500rpm离心10min,沉淀用数mL70%乙醇洗。

16、待乙醇挥发干净后,将沉淀溶于1-5mLTE或DDW(双蒸水)中。

溶液配制

一、溶液Ⅰ配制

溶液Ⅰ组成:葡萄糖,EDTA,Tris-HCl。三种物质在溶液Ⅰ中的终浓度分别为:0.05mol/L葡萄糖,0.025mol/L Tris-HCl、pH8.0,0.01mol/L EDTA、pH8.0。

配制方法:按上述各物质终浓度,把各自均配制成十倍浓度的溶液,配制溶液Ⅰ时,取三种十倍溶液各1体积于一容器中,定容至10体积即得溶液Ⅰ。

配制体积 500mL 1000mL

(1)葡萄糖(M=198.17): 0.05 mol/L 4.954g 9.909g

10倍: 0.5 mol/L 49.54g 99.09g

(2) Tris-HCl(M=121.1): 0.025 mol/L 1.514g 3.028g

10倍: 0.25 mol/L 15.14g 30.28g

(3)EDTA(M=372.24): 0.01 mol/L 1.861g 3.722g

10倍: 0.1 mol/L 18.61g 37.22g

注:溶液Ⅰ一次可配制100mL或更多,在15psi(1.05kg/cm2)压力下蒸汽高压灭菌15~30min,保存于4℃环境中备用。

二、溶液Ⅱ配制(现用现配,不用高压灭菌)

溶液Ⅱ组成:NaOH,SDS。两种物质在溶液Ⅱ中的终浓度分别为:0.2mol/L NaOH,1%SDS(m/V)。根据需要体积(V),各自配制成2倍浓度1/2体积(V/2),两者等体积混合即得。

配制体积 250mL 500mL

(1)NaOH(M=40.01): 0.2 mol/L 2.00g 4.00g

2倍: 0.4 mol/L 4.00g 8.00g

(2)SDS(M=121.1): 1% 2.5g 5g

2倍: 2% 5g 10g

三、溶液Ⅲ配制(用乙酸调Ph4.8)

溶液Ⅲ组成:乙酸钾,冰乙酸。两种物质在溶液Ⅲ中的终浓度分别为:5mol/L乙酸钾,冰乙酸(由溶液Ⅲ体积决定),即配制100体积溶液Ⅲ:60体积5mol/L乙酸钾,11.5体积冰乙酸,28.5体积灭菌水。

例如:预配制100mL溶液Ⅲ:

5mol/L乙酸钾: 60.0mL

冰乙酸: 11.5mL

灭菌水: 28.5mL

配制体积 500mL 1000mL

(1)乙酸钾(M=98.14): 5mol/L 245.35g 490.7g

注:溶液Ⅲ不需要高压灭菌,但5mol/L乙酸钾溶液需要高压灭菌!

三、TE溶液配制(需要高压灭菌)

TE溶液组成:Tris-HCl,EDTA。两种物质在TE溶液中的终浓度分别为:0.01mol/L Tris-HCl、pH8.0,0.001mol/L EDTA、pH8.0。

配制体积 500mL 1000mL

(1) Tris-HCl(M=121.1): 0.01 mol/L 0.6055g 1.211g

10倍: 0.1 mol/L 6.055g 12.11g

(2) EDTA(M=372.24): 0.001 mol/L 0.1861g 0.3722g

10倍: 0.01 mol/L 1.861g 3.722g

注:TE溶液使用量比较大时,可配制成十倍的TE溶液,用时再稀释。

五、5mol/L氯化锂溶液配制(需要高压灭菌)

配制体积 500mL 1000mL

(1)无水氯化锂(M=42.39): 5mol/L 105.98g 211.95g

(2)一水氯化锂(M=60.41): 5mol/L 151.025g 302.05g

六、PEG-NaCl溶液配制(不用高压灭菌)

PEG-NaCl溶液组成:PEG8000,NaCl。两种物质在TE溶液中的终浓度分别为:13%PEG(m/V),1.6 mol/L NaCl。(注:m/V即质量/体积)

配制体积 500mL 1000mL

(1)PEG(M=): 13% 65g 130g

(2)NaCl(M=58.44): 1.6 mol/L 46.75g 93.50g

七、LB液体培养基配制(高压灭菌)

配制一升LB液体培养基配方: 一倍配方 十倍配方

(胰)蛋白胨: 10g 100g

酵母提取物: 5g 50g

氯化钠: 5g 50g

注:液体培养基用量较大时,可配制成10倍的培养基,用时稀释即可。

八、LB固体培养基配制(高压灭菌)

配制一升LB固体培养基配方:

(胰)蛋白胨: 10g

酵母提取物: 5g

氯化钠: 5g

琼脂粉: 15g

九、核糖核酸酶A溶液配制

制备不含DNA酶的RnaseA:将胰核糖核酸酶(RnaseA)溶解在0.01mol/L的醋酸钠缓冲液(pH5.2)中,使终浓度为10mg/mL,沸水煮15min,放在室温下,缓慢冷却,用0.1体积的1M Tris-HCl(pH8.0)调整pH至7.4左右,分装小管保存在-20℃备用。

注:当浓缩的溶液在中性pH条件下加热到100℃时,核糖核酸酶(RnaseA)会产生沉淀。

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