蛋白序列分析软件包ANTHEPROT 4.3中文使用说明
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蛋白序列分析软件包ANTHEPROT 4.3中文使用说明 来源：易生物实验 浏览次数：0 网友评论 0 条 蛋白序列分析软件包ANTHEPROT 4.3是位于法国的蛋白质生物与化学研究院（Institute of Biology and Chemistry of Proteins）用十多年时间开发出的蛋白质研究软件包。软件包包括了蛋白质研究领域所包括的大多数内容 关键词：
蛋白序列分析软件包ANTHEPROT 4.3是位于法国的蛋白质生物与化学研究院（Institute of Biology and Chemistry of Proteins）用十多年时间开发出的蛋白质研究软件包。软件包包括了蛋白质研究领域所包括的大多数内容，功能非常强大。应用此软件包，使用个人电脑， 便能进行各种蛋白序列分析与特性预测。感谢软件的编写者，他们将此软件包免费提供给此领域的同行使用，这对于我国的科学技术人员来说，实在是一件好事。因 为一个功能再多再好的专业应用软件，如果作为商业软件进行销售的话，往往使大多数需要使用此软件的科技人员因为科研经费的问题，无缘使用，这点在我国尤为 突出。 软件分为三个版本，分别用于Unix系统，DOS系统与WINDOWS95或98系统，让我以用于WINDOWS系统的版本为例，介绍一下这个软件的基本用法。 软件包为一个自解压执行文件，文件名Anthe4_3c.exe，大小为1.9兆。执行此文件，输入解压后存放的目录名，便可将所有文件解压在此目录下。主程序名为Anthewin，在桌面上建立它的快捷图标，双击快捷图标便打开了ANTHEPROT 4.3主窗口。 通过主程序，我们可以载入蛋白序列，对序列进行编辑、打印、拷贝、改变设定等操作，更重要的是，我们可以在此调用各种所需的分析工具，对蛋白序列进行分析。 一． 序列编辑功能 ANTHEPROT 4.3的主窗口便是其序列编辑窗口： 可以使用
单序列文件格式：.SEQ，（ANTHEPROT 3.3支持以下格式的单序列文件：DNA/Strider 格式、EMBL格式、NBRF格式、Pearson/Fasta格式、PIR 格式与IG/Stanford格式); 含有多个蛋白序列的蛋白数据库文件：.BAS，(以Pearson/Fasta格式添加序列，上限为30条序列或32K文件大小); ClustalV 或ClustalW 文件：.ALN_含有ClustalW格式的多队列； 含有多队列的Multalin 4.1格式文件：.MUL； 在Prosite 蛋白数据库中查寻出Site结果的文件：.SIT， 蛋白质原子空间结构的PDB格式文件：.PDB； 使用IBCP（）服务器预测蛋白二级结构所获得的结果文件格式：.CNS； 序列可以从ANTHEPROT编辑窗口以键盘输入，或者以.SEQ等文件格式载入，也可以从其它文件复制粘贴到编辑窗口。最简单的序列格式为 Pearson/Fasta格式，为文本格式文件，带有>开始的为序列蛋白的名称，其后便是蛋白序列。下面为一个此格式的例子： >MBN VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDL KKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGD FGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG 程序支持的一些编辑功能如下： 取消，恢复（Undo）：Ctrl+Z。 查找Ctrl+T。 支持复制与粘贴。 可以自定义字符颜色，背景色与打印字体。 可打印序列文件。 输入或载入序列后，便同时打开了一个图像窗口，以彩图的形式显示出蛋白序列。不同的蛋白残基以不同的颜色表示。下面便是打开一个序列后的主程序窗口的例子：
二．工具栏与基本功能 当序列格式识别后，Methods菜单便被激活，相应的快捷按键也出现在工具栏中。
打开文件按键；存储文件按键；打印按键 ；更改字体与格式按键；更改设定颜色按键；进行蛋白序列二级结构预测； 在蛋白序列中查找符合PROSITES数据库的特征序列；绘制出蛋白序列的所有理化特性曲线；在Internet或本地蛋白序列数据库中查找类似序列； 计算蛋白序列分子量，比重与各蛋白残基百分组成；计算蛋白序列滴定曲线与等电点；选定一个片段后，绘制Helical Wheel图 ； 进行点阵图（Dot Plot）分析 ；计算信号肽潜在的断裂位点；打开一个简单的帮助文件；退出程序 (责任编辑：大汉昆仑王) |
