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表达谱基因芯片样品制备指南

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一、说明
本指南的目的在于向客户介绍用于表达谱芯片的样品制备的一般原则以及我公司对于客户样品的基本要求。包括在样品采集、制备、贮存、运输各阶段需要遵循的一般原则、注意事项等,以及我公司基于对样品质量和数量的要求而提供的各种类型样品的采集、制备等方面建议流程(在满足我公司样品要求的范围内,所有操作规程仅供客户参考)。

二、样品制备的基本原则
代表性原则:取样的代表性直接关系到实验结果的最后解释。应该根据您的实验目的慎重选择您的取样方案,包括样品类型(单一或混合组织类型,单一或混合细胞类型等),取样的操作流程,对照组的设定。基本要求是实验处理组和对照组的样品在取材方式和处理条件等方面尽可能保持一致,否则可能会影响实验结果的可信度。
准确性原则:取样的准确性直接关系到实验结果的科学意义。所有样品(实验组和对照组)的取材必须快速准确同时立即进行后续处理(样品固定化或RNA提取),以减少外界因素对样品原始特性的改变,否则最后的实验结果将难以反映样品的真实特性。
规范性原则:实验过程的操作包括样品收集、贮存、运输以及后续处理是决定芯片实验结果的稳定性和可信度的最关键因素。因此必须制订和严格执行规范化的操作规程。
可能涉及的问题包括:样品质量问题(RNA降解或含有影响后续操作的杂质如蛋白质,基因组DNA,盐类);样品收集过程的不规范性(实验组与对照组取样标准的差异,取样操作设计与实验目的的偏差)。

三、本公司可接收的样品类型及样品量
本公司可接收的样品类型包括:冷冻或新鲜组织、培养或分离的细胞以及RNA 样品。同时本公司还可以根据客户的要求在公司内部实验室进行包括细胞培养,不同条件的处理以及样品的收集工作。客户如果提供除此以外其它特殊类型的样品请咨询本公司商务中心。
对于样品量的要求必须根据客户提供样品的取材难易以及客户要求提供的芯片服务类型而异。包括:对于取材量不受限制和不要求进行扩增的样品,客户需按每张芯片提供至少60μg总RNA或总RNA可提取量相当的其他类型样品;对于取材相对较难或根据客户实验的要求必须进行扩增处理的样品,客户需按每张芯片提供至少5μg的总RNA或总RNA可提取量相当的其他类型样品;对于其他特殊情形或客户有任何疑问请咨询本公司商务中心了解详细情况。
由于样品类型直接影响到其中的总RNA产量,对于不同的样品所需要的原始样品量也有差异,需要客户自己掌握或咨询本公司商务中心。

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