DNA的琼脂糖凝胶电泳实验原理和方法步骤
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一、实验目的
学习和掌握琼脂糖电泳法鉴定DNA的原理和方法。
二、实验原理
琼脂糖凝胶电泳是用于分离、鉴定和提纯DNA片段的标准方法。琼脂糖是从琼脂中提取的一种多糖,具亲水性,但不带电荷,是一种很好的电泳支持物。DNA在碱性条件下(pH8.0的缓冲液)带负电荷,在电场中通过凝胶介质向正极移动,不同DNA分子片段由于分子和构型不同,在电场中的泳动速率液不同。溴化乙锭(EB)可嵌入DNA分子碱基对间形成荧光络合物,经紫外线照射后,可分出不同的区带,达到分离、鉴定分子量,筛选重组子的目的。
三、实验材料
实验14提取的DNA样品,
四、器具及药品
电泳仪,电泳槽,紫外透射反射仪,恒温 水浴 锅,微波炉,微量进样器,三羟甲基氨基甲烷,盐酸,醋酸钠,EDTA,琼脂糖,溴酚蓝,溴化乙锭。
五、实验步骤
1、安装电泳槽
将有机玻璃的电泳凝胶床洗净,晾干,用胶带将两端的开口封好,放在水平的工作台上,插上样品梳。
2、琼脂糖凝胶的制备
称取琼脂糖溶解在电泳缓冲液中,(按0.3-1.5%的琼脂糖含量,1-25kb大小的DNA用1%的凝胶,20-100kb的DNA用0.5%的凝胶,200-2000bp的DNA用1.5%的凝胶)置微波炉或沸 水浴 中加热至完全溶化(不要加热至沸腾),取出摇匀。
3、灌胶
将冷却到60℃的琼脂糖溶液轻轻倒入电泳槽水平板上。
4、待琼脂糖胶凝固后,在电泳槽内加入电泳缓冲液,然后拔出梳子。
5、加样
将DNA样品与加样缓冲液按4:1混匀后,用微量 移液器 将混合液加到样品槽中,每槽加10-20μl,记录样品的点样次序和加样量。
6、电泳
安装好电极导线,点样孔一端接负极,另一端接正极,打开电源,调电压至3-5V/cm,电泳1-3hr,当溴酚蓝移到距凝胶前沿1-2cm时,停止电泳。
7、染色和观察
取出凝胶,放在含有溴化乙锭的染色液中染色30min,即可在254nm的紫外灯下观察,有橙红色荧光条带的位置,即为DNA条带,或在紫外灯下照相记录电泳图谱。溴化乙锭是致癌剂,操作时要小心,必须戴手套。
附:
⑴5×TBE(tris-硼酸及 EDTA )缓冲液的配制(1000ml):
Tris 54g,硼酸27.5g,0.5mol/L EDTA 20ml,将pH调到8.0,定容至1000ml,4℃冰箱保存,用时稀释10倍。
⑵加样缓冲液的配制:
0.25%溴酚蓝,40%(W/V)蔗糖水溶液,4℃冰箱保存。
⑶溴化乙锭的配制:
称取0.1g溴化乙锭,溶于10ml水,配成终浓度为10mg/ml的母液,4℃冰箱保存。染色时,吸取12.5μl的母液,加入250ml的水中,使其终浓度为0.5μg/ml,混合均匀。
⑷100倍TE缓冲液的配制:
1mol/L Tris -HCl(pH8.0),100mmol/LEDTA
称取 Tris 121.1g,EDTA-Na 2 37.23g,先用800ml双蒸水,加热搅拌溶解后,再用盐酸调pH至8.0(大约加入盐酸20ml),然后定容至1000ml。
⑸100倍电泳 缓冲液 的配制:
4mol/LTris-HCl(pH8..0),2mol/L醋酸钠,200mmol/LEDTA
称取Tris242.2g,无水乙酸钠82.03g,EDTA-Na 2 37.23g,先用400ml双蒸水加热搅拌溶解后,再用冰乙酸调pH至8.0(大约加入冰乙酸50ml),然后定容至500ml。用时稀释100倍。
学习和掌握琼脂糖电泳法鉴定DNA的原理和方法。
二、实验原理
琼脂糖凝胶电泳是用于分离、鉴定和提纯DNA片段的标准方法。琼脂糖是从琼脂中提取的一种多糖,具亲水性,但不带电荷,是一种很好的电泳支持物。DNA在碱性条件下(pH8.0的缓冲液)带负电荷,在电场中通过凝胶介质向正极移动,不同DNA分子片段由于分子和构型不同,在电场中的泳动速率液不同。溴化乙锭(EB)可嵌入DNA分子碱基对间形成荧光络合物,经紫外线照射后,可分出不同的区带,达到分离、鉴定分子量,筛选重组子的目的。
三、实验材料
实验14提取的DNA样品,
四、器具及药品
电泳仪,电泳槽,紫外透射反射仪,恒温 水浴 锅,微波炉,微量进样器,三羟甲基氨基甲烷,盐酸,醋酸钠,EDTA,琼脂糖,溴酚蓝,溴化乙锭。
五、实验步骤
1、安装电泳槽
将有机玻璃的电泳凝胶床洗净,晾干,用胶带将两端的开口封好,放在水平的工作台上,插上样品梳。
2、琼脂糖凝胶的制备
称取琼脂糖溶解在电泳缓冲液中,(按0.3-1.5%的琼脂糖含量,1-25kb大小的DNA用1%的凝胶,20-100kb的DNA用0.5%的凝胶,200-2000bp的DNA用1.5%的凝胶)置微波炉或沸 水浴 中加热至完全溶化(不要加热至沸腾),取出摇匀。
3、灌胶
将冷却到60℃的琼脂糖溶液轻轻倒入电泳槽水平板上。
4、待琼脂糖胶凝固后,在电泳槽内加入电泳缓冲液,然后拔出梳子。
5、加样
将DNA样品与加样缓冲液按4:1混匀后,用微量 移液器 将混合液加到样品槽中,每槽加10-20μl,记录样品的点样次序和加样量。
6、电泳
安装好电极导线,点样孔一端接负极,另一端接正极,打开电源,调电压至3-5V/cm,电泳1-3hr,当溴酚蓝移到距凝胶前沿1-2cm时,停止电泳。
7、染色和观察
取出凝胶,放在含有溴化乙锭的染色液中染色30min,即可在254nm的紫外灯下观察,有橙红色荧光条带的位置,即为DNA条带,或在紫外灯下照相记录电泳图谱。溴化乙锭是致癌剂,操作时要小心,必须戴手套。
附:
⑴5×TBE(tris-硼酸及 EDTA )缓冲液的配制(1000ml):
Tris 54g,硼酸27.5g,0.5mol/L EDTA 20ml,将pH调到8.0,定容至1000ml,4℃冰箱保存,用时稀释10倍。
⑵加样缓冲液的配制:
0.25%溴酚蓝,40%(W/V)蔗糖水溶液,4℃冰箱保存。
⑶溴化乙锭的配制:
称取0.1g溴化乙锭,溶于10ml水,配成终浓度为10mg/ml的母液,4℃冰箱保存。染色时,吸取12.5μl的母液,加入250ml的水中,使其终浓度为0.5μg/ml,混合均匀。
⑷100倍TE缓冲液的配制:
1mol/L Tris -HCl(pH8.0),100mmol/LEDTA
称取 Tris 121.1g,EDTA-Na 2 37.23g,先用800ml双蒸水,加热搅拌溶解后,再用盐酸调pH至8.0(大约加入盐酸20ml),然后定容至1000ml。
⑸100倍电泳 缓冲液 的配制:
4mol/LTris-HCl(pH8..0),2mol/L醋酸钠,200mmol/LEDTA
称取Tris242.2g,无水乙酸钠82.03g,EDTA-Na 2 37.23g,先用400ml双蒸水加热搅拌溶解后,再用冰乙酸调pH至8.0(大约加入冰乙酸50ml),然后定容至500ml。用时稀释100倍。