白细胞标本DNA PCR反应模板的制备
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方法一
1. 试剂与配制
蛋白酶K:20mg/L 溶于10mmol/L Tris-HCl pH7.5
TE缓冲液(pH7.5 或8.0)
PBS(磷酸盐缓冲液)
钾缓冲液:50mmol/L KCl,10~20mmol/L Tris-Cl,2.5mmol/L MgCl(pH8.3),1%laureth12 ,0.5% Tween-20,蛋白酶K(100μg/ml)
2.操作方法
① 通过密度梯度离心法,分离1~2ml全血中的单核细胞;
② 用PBS缓冲液洗单核细胞2次,然后计数;
③ 用100μl钾缓冲液悬起部分细胞,使其浓度为5000个/μl;
④ 56℃水浴45min,消化细胞;
⑤ 95℃ 保温10min,灭活蛋白酶K,取10μl上清进行100μl PCR反应。
方法二
1. 试剂与配制
1%SDS,10mmol/L EDTANa2
玻璃粉悬液(50%水溶液)
乙醇漂洗液:50%乙醇,10mmol/L Tris-Cl(pH7.4),1mmol/L EDTA,50mmol/L NaCl
2. 操作方法
① 将收集的白细胞(2×105)与50μl含1%SDS的10mmol/L EDTANa2混匀;
② 再加入150μl 4mol/L NaCl 和5μl玻璃粉悬液(50%水溶液),混匀;
③ 置冰上5min,1000g离心1min;
④ 弃上清,用300μl乙醇漂洗液洗沉淀三次;
⑤ 加入100μl水于结合有玻璃粉的DNA沉淀中,55℃ 保温3min。1000g离心1min,50μl上清即可用于PCR。
方法三
1. 试剂与配制
细胞裂解液:10mmol/L Tris-Cl(pH7.5),10mmol/LMgCl2,10mmol/LNaCl
白细胞核裂解液(pH8.0):10mmol/L Tris-Cl(pH8.0),400mmol/LNaCl,2mmol/L EDTA
TE缓冲液(pH7.5 或8.0)
10%SDS
蛋白酶E:10mg/ml 溶于双蒸水中,37℃水浴2hr,储存于-20℃
饱和乙酸钠溶液:将200克结晶乙酸钠(CHCOONa-3H20)溶于100ml蒸馏水中,有结晶析出,取上清备用。
3mol乙酸钠(pH5.2)
无水乙醇
70%乙醇
2. 操作方法
① 将20ml细胞裂解液加入到5ml抗凝血中,混匀,1000g离心10min,收集白细胞沉淀,再用10ml细胞裂解液重复一次;
② 加入8ml细胞核裂解液至白细胞沉淀中,混匀,3000g离心10min;
③ 收集沉淀,加入3ml白细胞核裂解液充分混匀;
④ 加250μl蛋白酶E(10mg/ml)和400μl 10%SDS,快速充分混匀;
⑤ 37℃水浴过夜或50℃水浴3hr;
⑥ 加1ml饱和乙酸钠,振摇15s,2000g离心15min;
⑦ 将上清移出,加入1/10体积的3mol乙酸钠(pH5.2),混匀,再加入2.5倍体积的无水乙醇沉淀DNA;
⑧ 70%乙醇洗2次,TE溶解,4℃保存。