基因芯片的主要作用
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基因芯片的主要作用
用于
RNA
水平的大规模基因表达谱的研究
由于基因芯片
在固定介质和标记染料方面的优势,可以实现同一张芯片上多种荧光标记。利用双色荧光系统,可以在一张芯片上实现待测样本和对照样本靶序列的同时检测。基因芯片对于基因表达谱的研究就是利用了这一性质。将待测及对照两种组织的mRNA通过反转录分别用两种不同的荧光标记到两种组织的cDNA上,从而制备成探针,混合后与基因芯片进行杂交,两种不同标记的靶序列与芯片上同一个点上的探针竞争性杂交,通过芯片扫描仪扫描及计算机处理就能确定芯片上每个点上的两种荧光信号强弱。信号强弱的比值理论上反映了该基因在实验组和对照组中表达丰度的比值,即在两种组织中表达改变的情况。因此,通过基因芯片就能对成千上万的基因高通量、平行性地进行表达谱研究。
基因芯片检测
DNA
的结构及组成
基因芯片可以从不同的方面对DNA进行检测,如DNA的测序和再测序、DNA的甲基化检测、基于芯片的比较基因组杂合(CGH)技术等。其中最基本的是利用基因芯片的杂交测序原理。基于芯片的CGH技术与表达谱基因芯片类似,只是CGH是研究基因组的拷贝数改变代替了基因表达丰度的改变。