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Omega质粒大量提取流程

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5419

实验试剂

 

1. 使用前,将RNase A全部加入Solution I中并于4度保存。

2. 按下表用无水乙醇稀释DNA Wash Buffer,并于室温保存。

    D6926-00B: 加入60ml无水乙醇

    D6926-01B: 加入160ml无水乙醇

    D6926-03B: 加入200ml无水乙醇

    D6926-04B: 每瓶中加入200ml无水乙醇

实验步骤

 

1. 取100- 200ml 菌液3,500-5,000 x g室温离心10min收集菌体沉淀;

2. 小心去除上清液,加10 ml Solution Ⅰ/ RNase A,涡旋或用移液枪上下吹打重悬菌体;

3. 加10 ml SolutionⅡ,来回颠倒10- 15次轻柔混匀,得到澄清的裂解液。

4. 加5 ml Buffer N3,颠倒混匀几次直至出现白色絮状沉淀,室温放置2-3min让其充分反应。

5. 准备结合柱——加5ml的Buffer GPS至结合柱中,室温放置3-10min,3,000-5,000×g离心5min,弃滤液,往柱子里加入10ml无菌水离心弃滤液后,把柱子插入50ml收集管中。

6. 把第4步中获得的溶液及沉淀物全部转移至针筒式过滤器中,室温放置2min后推压过滤器,用一个新的50ml离心管收集滤出的清液(此步可用“15,000×g 4℃离心10min得上清”代替)。

7. 第6步获得上清液后,加入与上清等体积的ETR Binding Buffer,颠倒混匀7-10次。

8. 结合质粒——把准备好的结合柱插入50ml收集管,小心转移混合液至结合柱柱里,3,000-5,000×g离心3-5min,弃滤液。

9. 重复第8步,直至所有上清都过滤完,弃滤液。

10.加入10ml ETR Wash Buffer到结合柱上,3,000-5,000×g离心3-5min,使全部液体滤过柱子,弃滤液。

11. 加入10 ml Buffer EHB到结合柱上,3,000-5,000×g离心3-5min使全部液体滤过柱子,弃滤液;

12. 加入15 ml DNA Wash Buffer到结合柱上3,000-5,000×g离心3-5min使全部液体滤过柱子,弃滤液;

注意:浓缩的DNA Wash Buffer在使用之前必须按标签的提示用无水乙醇稀释。

13. 加入10ml DNA Wash Buffer到结合柱上3,000-5,000×g离心3-5min使全部液体滤过柱子,弃滤液;

14. 把空柱子套回离心管,最大转速(不超过6, 000×g)离心10-15min干燥柱子;

15. 进一步干燥柱子——把柱子转移真空抽滤装置上抽滤10min或把柱子放入65℃恒温箱10-15min;

16. 把结合柱套在一个新的50ml离心管中,加入1-3ml Endotoxin-Free Elution Buffer,室温放置2-5min,最高转速离心5min洗脱质粒DNA。

备注:第一次洗脱可洗脱出60-80%结合在膜上的DNA,进行二次洗脱可洗脱出更多的DNA,提高DNA产量,但同时浓度会降低;使用预热到70℃的洗脱液可提高洗脱效率。

如需浓缩质粒DNA可参照以下操作:

1. 按常规操作到第15步结束后,把结合柱套在一个新的50ml离心管中,加入6ml预热到70℃的Endotoxin-Free Elution Buffer(或无菌水),室温放置2—5min,最高转速(不超过6, 000×g)离心5min洗脱质粒DNA;

2. 小心转移洗脱产物至一个干净的容器中进行沉淀,加入260 ul 5M NaCl和4.4ml 室温异丙醇,涡旋混匀后15,000×g,4℃离心30min,收集质粒DNA沉淀,小心去除上清;

3. 加入2ml 70%乙醇轻柔吸打洗涤质粒DNA沉淀后,15,000×g,离心10min,小心倒掉上清。空气干燥5—10min至乙醇完全去除(如10min后仍有乙醇气味残留,可增加干燥时间);

4. 用200—500ul Endotoxin-Free Eluiton Buffer或无菌水(洗脱体积取决于下游实验所需质粒浓度)溶解DNA。

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