【信息】美08掀非编码RNA研究热潮
丁香园
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近年来，非编码RNA（即没有被翻译成蛋白质的RNA）在调控基因表达中扮演至关重要的角色已经成为一个清楚的事实。对包括microRNA，siRNA等的非编码RNA的研究更是研究的焦点。这些领域研究的不断的深入也使我们对基础生命物质有了新的了解、认识。近年来，国内外在非编码RNA方面的研究取得了多项令人瞩目的成就。2008年即将来临之际，美国卫生研究院在上周五宣布说，计划在2008年拨款150万美元用于研究非编码RNA和其他转录后调节机制在成瘾过程中的作用。这个资助项目的公布可说是拉开了美国2008年对非编码RNA热点资助的序幕。
这项由美国药物滥用研究所和神经科学、精神健康和成瘾研究所管理的经费将赞助与神经元发育、神经元功能、疾病病因和疾病治疗有关的ncRNA和转录后调节因子的鉴定了功能研究。欲申请资助的研究项目必须是有助于提高对于药物滥用和成瘾有关的中枢神经系统重ncRNA和转录后调节因子的了解。NIH指出，尽管对ncRNA的神经元功能的研究尚处于起步阶段，但是一些ncRNA已经被证实能够调节树突的发育、神经元命运和分化以及突触蛋白合成。
NIH表示，ncRNA在成瘾中可能的作用还不完全清楚，但是ncRNA可能在一些与药物接触和药物依赖性有关大脑和神经元变化中具有重要意义。
非编码RNA（ncRNA）是近年来发现的一类能转录但不编码蛋白质且具有特定功能的RNA小分子。目前的研究显示，ncRNA的主要功能有：参与mRNA的稳定和翻译水平的调节、参与蛋白质的运输、参与RNA的加工和修饰、影响染色体的结构等。目前研究ncRNA但主要方法有：比较基因组生物信息分析发现ncRNA、分离特定的cDNA克隆用于富集ncRNA、利用芯片系统检测整个基因组以获得新转录物。
国内外科研工作者近年来在这个领域取得了多项重大成果。
张雅鸥教授microRNA研究取得新进展
在刚刚结束的第九届中国细胞生物学大会上，来自清华大学深圳研究生院的女教授张雅鸥报告了她的研究团队在microRNA（miRNA）的基因结合位点方面的研究成果。
中科院研究发现大量新非编码RNA
来自中科院生物物理所的研究人员对模式生物——线虫基因组内含子中大量非编码蛋白的小RNA进行了深入的分析。他们确定了100个以前从未发现过的转录产物，其中包含了2个新的类别。他们的研究进一步了解了线虫基因组的结构与非编码RNA的转录调节，并且更加明确了非编码RNA在发育过程中起到重要的作用。这项研究成果发表在1月的Genome Research上。
利用一种新的、高通量克隆小的全长ncRNA方法，陈教授实验室成功分离并鉴定出161种转录产物。采用的新克隆方法在检测ncRNA上有非常出色的表现，比起现有方法检测效率更高。
在新发现的161个转录产物中，100个是从未发现过的，61个是已知或者预测到的。在100个新基因中，30个没有已知功能，另外70个属于常见的小核RNA（small nucleolar RNA, snoRNA）。根据测序结果和结构特征，研究人员对30个未知功能RNA中超过半数进行了分类，它们可以归为2个新的类别：柄部突出RNA（stem-bulge RNA, ***RNA）和小核样RNA（small nuclear-like RNA, snlRNA）。这两类RNA都在线虫发育晚期表现出转录量上升的趋势，表明它们可能在这一阶段行使功能。
耶鲁大学非编码RNA最新发现
去年，美国耶鲁大学的一个研究组研究组发现一个大的、高度保守的RNA motif，这种RNA motif通常存在于极端革兰氏阳性真细菌（extremophilic Gram-positive eubacteria）的一种多基因mRNA的一个非编码部分。
这种类型的RNA采用了一种华丽的二级结构，并且只在特定的极端细菌中确定出来。这种华丽、大型、极端（OLE）RNA的长度大约为610个核苷，并且35个典型的核苷酸表现出了非同寻常的核苷酸序列和碱基对的保守性。
对Bacillus halodurans菌中OLE RNA的结构分析验证了通过比较序列分析预测到的一种复杂二级结构模型。这种结构保守模式和它的独特的系统发生分布揭示出OLE RNA只在特定的极端细菌中执行一种复杂和关键的功能。
摘自生物谷 www.bioon.com
这项由美国药物滥用研究所和神经科学、精神健康和成瘾研究所管理的经费将赞助与神经元发育、神经元功能、疾病病因和疾病治疗有关的ncRNA和转录后调节因子的鉴定了功能研究。欲申请资助的研究项目必须是有助于提高对于药物滥用和成瘾有关的中枢神经系统重ncRNA和转录后调节因子的了解。NIH指出，尽管对ncRNA的神经元功能的研究尚处于起步阶段，但是一些ncRNA已经被证实能够调节树突的发育、神经元命运和分化以及突触蛋白合成。
NIH表示，ncRNA在成瘾中可能的作用还不完全清楚，但是ncRNA可能在一些与药物接触和药物依赖性有关大脑和神经元变化中具有重要意义。
非编码RNA（ncRNA）是近年来发现的一类能转录但不编码蛋白质且具有特定功能的RNA小分子。目前的研究显示，ncRNA的主要功能有：参与mRNA的稳定和翻译水平的调节、参与蛋白质的运输、参与RNA的加工和修饰、影响染色体的结构等。目前研究ncRNA但主要方法有：比较基因组生物信息分析发现ncRNA、分离特定的cDNA克隆用于富集ncRNA、利用芯片系统检测整个基因组以获得新转录物。
国内外科研工作者近年来在这个领域取得了多项重大成果。
张雅鸥教授microRNA研究取得新进展
在刚刚结束的第九届中国细胞生物学大会上，来自清华大学深圳研究生院的女教授张雅鸥报告了她的研究团队在microRNA（miRNA）的基因结合位点方面的研究成果。
中科院研究发现大量新非编码RNA
来自中科院生物物理所的研究人员对模式生物——线虫基因组内含子中大量非编码蛋白的小RNA进行了深入的分析。他们确定了100个以前从未发现过的转录产物，其中包含了2个新的类别。他们的研究进一步了解了线虫基因组的结构与非编码RNA的转录调节，并且更加明确了非编码RNA在发育过程中起到重要的作用。这项研究成果发表在1月的Genome Research上。
利用一种新的、高通量克隆小的全长ncRNA方法，陈教授实验室成功分离并鉴定出161种转录产物。采用的新克隆方法在检测ncRNA上有非常出色的表现，比起现有方法检测效率更高。
在新发现的161个转录产物中，100个是从未发现过的，61个是已知或者预测到的。在100个新基因中，30个没有已知功能，另外70个属于常见的小核RNA（small nucleolar RNA, snoRNA）。根据测序结果和结构特征，研究人员对30个未知功能RNA中超过半数进行了分类，它们可以归为2个新的类别：柄部突出RNA（stem-bulge RNA, ***RNA）和小核样RNA（small nuclear-like RNA, snlRNA）。这两类RNA都在线虫发育晚期表现出转录量上升的趋势，表明它们可能在这一阶段行使功能。
耶鲁大学非编码RNA最新发现
去年，美国耶鲁大学的一个研究组研究组发现一个大的、高度保守的RNA motif，这种RNA motif通常存在于极端革兰氏阳性真细菌（extremophilic Gram-positive eubacteria）的一种多基因mRNA的一个非编码部分。
这种类型的RNA采用了一种华丽的二级结构，并且只在特定的极端细菌中确定出来。这种华丽、大型、极端（OLE）RNA的长度大约为610个核苷，并且35个典型的核苷酸表现出了非同寻常的核苷酸序列和碱基对的保守性。
对Bacillus halodurans菌中OLE RNA的结构分析验证了通过比较序列分析预测到的一种复杂二级结构模型。这种结构保守模式和它的独特的系统发生分布揭示出OLE RNA只在特定的极端细菌中执行一种复杂和关键的功能。
摘自生物谷 www.bioon.com
