【原创】一步一步教你使用NCBI（DNA/cDNA/mRNA/promoter/primer/protein/SNP查找,BLAST使用 最新更新关于SNP的若干问题）
丁香园论坛
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最近看到很多战友在论坛上询问如何查询基因序列、如何进行引物设计、如何使用BLAST进行序列比对……，这些问题在NCBI上都可以方便的找到答案。现在我就结合我自己使用NCBI的一些经历（经验）跟大家交流一下BCBI的使用。希望大家都能发表自己的使用心得，让我们共同进步！
我分以下几个部分说一下NCBI的使用：
Part one： 如何查找基因序列、mRNA、Promoter （第一页）
Part two ：如何查找连续的mRNA、cDNA、蛋白序列（第一页）
Part three ：运用STS查找已经公布的引物序列（第二页）
Part four： 如何运用BLAST进行序列比对、检验引物特异性（第三页）
Part Five：5.1 从SNP的序列号入手找到其对应的基因序列和该SNP在基因组中的具体位置。5.2 查找目的基因的所有已公布SNP位点（第四页）
如果您感觉网页形式看起来太乱，请到 http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=64&id=9681760&sty=1&tpg=2&age=0 下载PDF版本（此PDF版本为我实验室的lzfist所整理，包含前四部分内容）
特别感谢本版版主，将这个帖子置顶！
从发帖到现在，很多战友对该帖给与了积极的关注，在此向给我投票的（以及想给我投票却暂时不能投票的）各位战友表示真诚的感谢，谢谢各位战友！
请大家对以下我发表的内容提出自己的意见。关于NCBI其他方面的使用也请水平较高的战友给予补充。
First of all，还是让我们从查找基因序列开始。
Part one: 利用Map viewer查找基因序列、mRNA序列、启动子（Promoter）[同一个页面即可显示基因序列和启动子]
下面以人的IL6（白细胞介素6）为例讲述一下具体的操作步骤
一、打开Map viewer页面，网址为：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mapview/index.html
在search的下拉菜单里选择物种，for后面填写你的目的基因。操作完毕如图所示：
我分以下几个部分说一下NCBI的使用：
Part one： 如何查找基因序列、mRNA、Promoter （第一页）
Part two ：如何查找连续的mRNA、cDNA、蛋白序列（第一页）
Part three ：运用STS查找已经公布的引物序列（第二页）
Part four： 如何运用BLAST进行序列比对、检验引物特异性（第三页）
Part Five：5.1 从SNP的序列号入手找到其对应的基因序列和该SNP在基因组中的具体位置。5.2 查找目的基因的所有已公布SNP位点（第四页）
如果您感觉网页形式看起来太乱，请到 http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=64&id=9681760&sty=1&tpg=2&age=0 下载PDF版本（此PDF版本为我实验室的lzfist所整理，包含前四部分内容）
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请大家对以下我发表的内容提出自己的意见。关于NCBI其他方面的使用也请水平较高的战友给予补充。
First of all，还是让我们从查找基因序列开始。
Part one: 利用Map viewer查找基因序列、mRNA序列、启动子（Promoter）[同一个页面即可显示基因序列和启动子]
下面以人的IL6（白细胞介素6）为例讲述一下具体的操作步骤
一、打开Map viewer页面，网址为：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mapview/index.html
在search的下拉菜单里选择物种，for后面填写你的目的基因。操作完毕如图所示：
