NCBI使用方法之二：如何查找连续的mRNA、cDNA、蛋白序列
丁香园
17019
1、进入NCBI主页
在search后面选择Gene，在for后面填写需要查找的基因的名字。
点击“Go”，
出现了很多基因序列，在每个序列的右边还有“Order cDNA clone” 的链接，这些序列中有些序列是跟你的目的基因同名的，有些是别名（Other Aliases）与你的目的基因一致，根据每个序列的介绍认真选择你的目的基因。上图中我需要的IL6是标号为2的序列。
2.1、查找cDNA序列
2.1.1、点击Order cDNA clone, 出现目的页面如图所示：
2.1.2、点击Clone Sequence后面的链接即可得到cDNA序列。点击后如图所示（只抓取其中一部分）：
2.2、查找mRNA、蛋白序列
回到步骤1点击“Go”之后出现的页面，点击目的基因的名字，出现以下页面(只抓取相关部分)：
页面的下半部分，即可以获取mRNA和蛋白序列的部分：
找到“NCBI Reference Sequences (RefSeq)”，它分为几个板块，第一个“mRNA and ProteinMoon”区可以让我们找到连续的编码mRNA序列和蛋白序列。在mRNA and ProteinMoon下面有两个序列代码（中间划有一个箭头），这代表了mRNA序列和蛋白序列。分别点击就可以得到相应的序列页面。点击后如图所示，mRNA序列：
蛋白序列如下：
NCBI Reference Sequences (RefSeq)的第二个板块是Reference assembly，它下面显示的是Genomic ，点击Genomic下面Reference assembly对应的Genbank或FASTA即可出现编码的DNA序列（注意：只是编码序列，其中包括内含子，但一般没有5‘非编码区）。这一步就不做贴图演示了吧，呵呵。
这样我们就可以找到基因的cDNA序列、连续的编码mRNA序列、蛋白序列以及含有内含子的编码DNA序列了。相信这些操作对很多战友还是有用的。
