【交流】2.9kb 膜蛋白片段的EGFP-N3质粒克隆构建------快崩溃了
丁香园论坛
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接手一个2.9kb的克隆构建,装入到EGFP-N3上,选择Xhol/BamhI,片断和质粒酶且完毕,可是怎么也连不上,无奈换酶切位点,换为SalI/BamhI,可是同样问题出现了,怎么也连不上!
无奈先换成克隆半段1.5kb,SalI/BamhI的位点,非常容易得得到克隆, 可是还要全长的啊,在中间靠上的位置找了个unique的酶切位点ppumI,然后把下半段的P出来,使用ppumI/BamhI切好,把构建好的上半段的克隆也使用ppumI/BamhI切好,可是同样问题出现了,怎么也连不上,
疯掉了,然后使用ECORI且了一个自连的t载体,肯定是切动了,因为酶切前后带性和位置有明显差别,载体去磷后,然后把平末端的全长片段与之相连,可是同样问题出现了,怎么也连不上,
我快崩溃了,前前后后近三个月了,这里我把序列贴出来,大家给各意见,到底怎么了?? 2.9kb的克隆应该不这么难做,是不是下游BamHI位点有什么问题?序列如下
ctaggtcgac atgaatataagcaaaagtgagataacaactgaagcttctttaaaaccatctcggagatctctgccctgtctggctcagagctatgctcactcaaaaagcttgagtcaatctgcctcgctgtttcagtcaactgagagtgaatctcaggctccaacctctgtgacatttctttctgctgataaacctgaacatgttacttctgaggagagtagaaaagactctacccttaagtgttcctttgctgacctcagtgagttttgcttggctctggggaaagacaaggattacatggatgaatctgaacatgccaactatgatcgatctcgtctccttaatgactttgttaccaaagataaacctgaatccaagacaaagttatctaagaatgacatgaattacatagcatccagtgggcttttattcaaagatggcaaaaagagaattgattacatcctggtttatcgaaaaacaaatatacaatatgacaaaagaaacacatttgaaaagaacctgagagcagaaggcttgatgttggagaaggagccagcagttgccaatcctgacatcatgtttattaaagttcacattccatgggacacactgtgcaagtatgcagagaggctgaacatcagggtgcccttcaggaaaaaatgttactatactgaccagaagaacaagtcaatgagcagggtacaaaagtatttcaagagaatcaaaaaatggatgtcccaaaacccaatggttcttgacaagtcagcgtttccagagctggaggagtcggactgctacactggccctttcagcagagccaggattcaccactttataataaacaataaggacaccttcttcagcaacgctactcgcagcaggatagtctatcacatgttggaacgtaccaaatatgaaaacggaatatcaaaagtgggtattcgtaagcttatcaataatggctcatacatagcagcattccccccacacgagggagcctacaagagtagccttcccatcaaaacccatggacctcagaataacagacatctgttgtatgagcgctgggcacgctggggaatgtggtacaagcatcaacctctggacttaatcaggctgtactttggtgagaagattggcttatactttgcctggctgggatggtatactggaatgctgattcctgctgcagtggtcggcctatgtgttttcttctacggattagttacaatgaatgaaagtcaagtaagccaagaaatttgtaaagccaccgaagtcttcatgtgccctctgtgtgacaagaattgctcactgcagagactcaacgacagctgcatctatgccaaggtaacatatttgtttgataatggagggacagtcttcttcgctatttttatggcaatatgggccactgtctttcttgagttttggaaaaggagaagaagcatactgacttatacatgggaccttattgaatgggaagaagaggaggaaacacttcgtccccagtttgaagcaaaatactacaggatggagataataaaccctatcacagggaaacctgagcctcatcagccttcatctgacaaagtcacacgacttcttgtgtctgtctcagggatcttcttcatgatctccttggtcatcacagcagtgtttgcagttgtggtgtaccgtctggttgtcatggagcagtttgcatctttcaagtggaatttcatcaaacagcactggcagtttgctacatctggtgctgctgtctgtatcaacttcataatcatcatgctgctgaatcttgcctatgaaaaaattgcatacctcctcacaaatttagaatatcctcgaacagaatcagagtgggaaaacagctttgctttgaagatgttccttttccagtttgtcaatctgaacagttctatcttctatattgcattctttttgggaagattcgtaggccacccaggaaaatacaataaactttttgagcggtggagactggaggaatgccatcctagcggctgtctgatagacctctgcctccagatgggcgtcatcatgtttctgaagcaaatatggaacaacttcatggagctgggatatccgttaatccaaaactggtggtcacgacataaaatcaaacggggaatccaggatgcttccataccacaatgggaaaatgactggaaccttcagcctatgaacattcatgggctgatggacgaatacttagaaatggttttacagtttggttttactaccatctttgttgctgcttttcccctggcccctcttttggctttgttaaacaatatcatagaaatcagattggatgcatataaatttgtgacccagtggaggaggcctctgccagcccgagccactgacataggtatctggcttggaattcttgagggaattggcatattggctgtgatcaccaatgcatttgtaattgctattacatctgattacatcccacgttttgtctatgaatacaaatacggcccttgtgcaaatcatgtaaagcagaatgaaaattgcctgaagggatatgtcaacaatagcttatccttctttgacctgagtgaacttggtatcggaaaatccggttactgcaggtaccgagactatagaggccccccttggagttccaaaccctatgagttcaccttacagtactggcacatcctggctgctcgattggccttcattattgtgtttgagcatcttgtttttggcattaagtcattcattgcatacctgattccagatataccaaagggcctccgcgagcgcatacggcgagagaaatacttagttcaagaaatgatgtatgaggctgaactggaacatttacagcaacagagaagaaaaagtggtcagcctattcaccatgaatggccttagggatcc aga
难道是膜蛋白表达对于细菌造成致死性影响???
有几次是菌落PCR阳性,但是抽提质粒无结果,宿主菌是DH5a,应该不会表达吧?
无奈先换成克隆半段1.5kb,SalI/BamhI的位点,非常容易得得到克隆, 可是还要全长的啊,在中间靠上的位置找了个unique的酶切位点ppumI,然后把下半段的P出来,使用ppumI/BamhI切好,把构建好的上半段的克隆也使用ppumI/BamhI切好,可是同样问题出现了,怎么也连不上,
疯掉了,然后使用ECORI且了一个自连的t载体,肯定是切动了,因为酶切前后带性和位置有明显差别,载体去磷后,然后把平末端的全长片段与之相连,可是同样问题出现了,怎么也连不上,
我快崩溃了,前前后后近三个月了,这里我把序列贴出来,大家给各意见,到底怎么了?? 2.9kb的克隆应该不这么难做,是不是下游BamHI位点有什么问题?序列如下
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难道是膜蛋白表达对于细菌造成致死性影响???
有几次是菌落PCR阳性,但是抽提质粒无结果,宿主菌是DH5a,应该不会表达吧?