【求助】新手求助定点突变方法的选择

woxingwosu wrote:
感觉置换掉比较好，比较有说服力，文献上采用较多的还是将核心区的碱基置换掉。

westernblotx wrote:
我个人觉得，对于这个突变策略的选择，是很难在一开始就确定的。一个好的研究，要求的是数据的说服力。而说服力的背后是详实丰富的数据在支持。因此你选择什么样的策略，取决于这个课题的研究基础和背景。楼上的意见是中肯的，substitution是最常见的研究功能的方法，其中又以transversion最为首选，即purine （被）取代pyrimidine。在确定某个motif中的base有重要作用，接下来的工作就可以考虑deletion、ectopic activity/function assay（即把该元件等移动到gDNA其他位置看其是否仍然有功能），对复杂的一些motif来讲，有的时候该motif中的某两段间隔的碱基都很重要，这还需要考虑是牵涉的碱基是距离上的作用更大还是碱基序列本身的影响更大。