【求助】microRNA106-b~25的~25，是什么意思？

microRNA106-b~25的~25，是什么意思？

自己顶顶，让更多的人看到。

关于miRNA的命名，请参考： Victor Ambros, Bonnie Bartel, David P. Bartel, Christopher B. Burge, James C. Carrington, Xuemei Chen, Gideon Dreyfuss, Sean R. Eddy, Sam Griffiths-Jones, Mhairi Marshall, Marjori Matzke, Gary Ruvkun, and Thomas Tuschl. A uniform system for microRNA annotation. RNA 2003 9(3):277-279.

http://www.mirbase.org/help/nomenclature.shtml

还是没搞明白呀。

你读读上述参考文献的原文吧，可以认为microRNA106是发现的miR的序号，是成熟miR的命名，可以把miR106理解成一个族，miR106b理解成一个亚族；miR106b-25就是这个亚族的成员。-25相当于这个成员的序列号。

命名与数据库有关，我引用的文献mirbase的方式，这个文献后面还列了很多过去的文献，例如，miRBase: microRNA sequences, targets and gene nomenclature Nucleic Acids Res January 1, 2006 34: D140-D144你读了之后跟我们大家分享一下心得吧。如果有不妥，你及时指出来。

参阅一下：http://biochemistry.dxy.cn/bbs/topic/16355072?tpg=1&age=0

http://www.mirbase.org/cgi-bin/mirna_entry.pl?acc=MI0000734

Clustered miRNAs
< 10kb from hsa-mir-106b

hsa-mir-106b 7: 99691616-99691697 [-]

hsa-mir-93 7: 99691391-99691470 [-]

hsa-mir-25 7: 99691183-99691266 [-]



为一个miRNA 簇，包含了三个不同的miRNA

懂了，谢谢各位。

为了更好地将miRNA与siRNA及其他非编码小RNA或mRundefined*段区分开来,科学家们对miRNA的命名作了如下规定：

(1)miRNA简写成miR-No.,它的基因简写成mir-No. 如miR-21；

(2)高度同源的miRNA在No.其后加英文字母(小写,一般从a开始) 如miR-199a 和miR-199b；

(3)由不同染色体上的DNA序列转录加工而成的具有相同成熟体序列的miRNA，则在后面加上阿拉伯数字以区分, 如miR-199a-1和miR-199a-2；

(4)如果一个前体的2个臂分别加产生miRNA，则根据克隆实验，在表达水平较低的miRNA 后面加“” ，如miR-199amiR-199undefined，或进行如下命名，miR-142-5p(也可命名为miR-142-s，表示从5' 端的臂加工而来)和miR-142-3p(也可命名为miR-142-as，表示从3?端的臂加工而来)；

(5)将物种缩写置于miRNA之前，如hsa-miR-195；

(6)确定命名规则之前发现的miRNA，如let-7，则保留原来名字。