【求助】PBMC里的几个基因mRNA转录与蛋白表达不一致

(重复发贴，请版主见谅！)
各位老师你们好！我是一名刚踏入研三的小硕，做了一年的基础实验，现在实验结果都出来了；但在分析时发现，所做的三个细胞因子中，有两个细胞因子的转录水平与其蛋白表达水平不一致；也就是说某组病人的细胞因子转录水平明显低于其他各组,且该转录水平与临床资料相关；但其蛋白表达水平却是高于其他组别，而与临床资料无相关性；对于这样的情况，我该如何解释实验结果？望请各位老师给予指点，学生感激不尽，谢谢！（转录水平检测使用的是Realtime-PCR,蛋白水平用的是Flow cytometry）

是否还存在某些调控因子调控这两个细胞因子的表达，比如miRNAs，虽然这两个细胞因子的转录水平在某病人组是明显低于其他组，但由于该病人组中调控这两个细胞因子的miRNAs转录水平也低甚至未表达（如因基因组区段缺失等等原因）而在其它组该miRNAs表达正常，这样的话，这两个细胞因子的蛋白表达水平就相对高。

谢谢，但是这也只能是猜测吧？论文讨论和结论部分如何写?

你的实验结果重复了没？如果可信度高，就实话实说。各种因子均以其蛋白形式发挥作用，蛋白水平与临床资料无相关性，说明此因子与你的疾病关系不大；阴性结果也是一种结果，没有必要强求阳性结果。你再查些文献报道，在讨论部分加强你的论点就可以。

可以计算与实验验证的。

我的mRNA实验结果每个都做了三个复孔，蛋白就做了一次！这个算不算重复？