【求助】miRNA芯片数据分析问题
丁香园论坛
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求助各位老师,近期我做了6张miRNA芯片,实验组3张,对照组3张,公司给我的数据只有相对值,没有P值。原因是芯片数量少,不需要做统计学分析。这种说法是否对?还有就是在计算差异倍数时是用实验组相对值分别除以对照组的相对值,倍数在2倍以上的入选。这样计算是否对,还是倍数计算也是要有相关软件的?我在这方面真是只菜鸟,不懂的很多,公司说的我感到有些可疑。:(
这个你在做的时候就应该跟人家说清楚啊?现在公司很狡猾的,所以你可能也只有在给点钱让他们继续分析一下。最好做芯片一类的东西要找大的公司,要不真的不可信。
谢谢zhujoker!现在有点后悔,呜呜!像我这样做的两组芯片,每组3张,要做统计学分析的话是用配对t检验还是两组样本均数t检验?我现在要自食其力了,我会一点SAS,但是不知道用哪种统计检验方法?
不对吧,我觉得做芯片只能看看你想要的结果,是否成立。一般是做6张可以了。但是还要有后继实验的啊,比如real time pcr,进行验证芯片结果。做几十例,然后做统计。
要是配对的样本做配对T检验,但先做F检验,看是正态还是偏态分布。然后选择合适的统计方法。
以上是个人意见。
要是配对的样本做配对T检验,但先做F检验,看是正态还是偏态分布。然后选择合适的统计方法。
以上是个人意见。
你好:我也曾经做过PCR-array芯片,首先我觉得你实验组和对照组各做3张完全可以计算P值,其次一般认为有差异的倍数是3倍,若是条件放宽一点,2倍的也可以入选。对于结果分析方面,有些公司在网站上直接提供了在线的分析软件,其实也不难,就是一个excel表格,在里面输入你做芯片的结果,其就可以自动计算出来P值以及差异倍数的。
不知道你用的是哪家的芯片做的,我们用的是Qiagen 的supperarray,你要是有兴趣可以去查一下,在网站上就直接有计算方法的。
不知道你用的是哪家的芯片做的,我们用的是Qiagen 的supperarray,你要是有兴趣可以去查一下,在网站上就直接有计算方法的。
老师,我是个新手,我想问问后续做的健康人miRNA芯片可以和前期做的病人miRNA芯片作比较吗?虽然芯片检测时间不一样,但是找的都是同一家公司,另外用的芯片是一致的。
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