【求助】什么样的miRNA才能算做组织特异性miRNA
丁香园论坛
1711
文献已经很多报道说某一miRNA在某一组织表达特异,但大多数miRNA不只在一个组织中表达,多数是在多个组织表达,而文献也将其表述为特异性表达miRNA,这个组织特异性miRNA如何鉴定的,可以根据某一miRNA在所有组织中的表达量平均值来定吗?如果高于这个平均值就是特异的?
我也有这样的疑问
Refer to this paper,or write to the author.
Identification of Tissue-Specific MicroRNAs from Mouse
http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B6VRT-45X0D1F-N&_user=440026&_coverDate=04%2F30%2F2002&_rdoc=1&_fmt=high&_orig=search&_sort=d&_docanchor=&view=c&_acct=C000020939&_version=1&_urlVersion=0&_userid=440026&md5=0df7d336d4924d0387dfebd85e4796b8
Identification of Tissue-Specific MicroRNAs from Mouse
http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B6VRT-45X0D1F-N&_user=440026&_coverDate=04%2F30%2F2002&_rdoc=1&_fmt=high&_orig=search&_sort=d&_docanchor=&view=c&_acct=C000020939&_version=1&_urlVersion=0&_userid=440026&md5=0df7d336d4924d0387dfebd85e4796b8
谢谢,freecell版主,看过文章后还是有疑问
如下图,文中说In spleen, miR-143是组织特异的,在spleen中,miR-143频率占大约总数的30%,在heart、spleen、cortex以及midbrain中克隆数分别为3 7 2 1,其中以spleen中最高,为7
作者在方法以及文中没有提及为什么说miR-143在spleen中是组织特异性表达的
我的问题是miR-143在heart、cortex以及midbrain中也表达了,只是克隆数较spleen少,那为什么只说在spleen特异表达?
特异表达与否是按克隆数最多的算吗?
如下图,文中说In spleen, miR-143是组织特异的,在spleen中,miR-143频率占大约总数的30%,在heart、spleen、cortex以及midbrain中克隆数分别为3 7 2 1,其中以spleen中最高,为7
作者在方法以及文中没有提及为什么说miR-143在spleen中是组织特异性表达的
我的问题是miR-143在heart、cortex以及midbrain中也表达了,只是克隆数较spleen少,那为什么只说在spleen特异表达?
特异表达与否是按克隆数最多的算吗?
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建议email给通信作者,讨论此事。
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这个话题不错,希望有识人士参与讨论,学习
关注中...
学习一下,很有意思的讨论。
很好的讨论主题。我粗略地查了一下,但只发现原文“In spleen, miR-143 appeared to be most abundant, at a frequency of ~30%.”,和楼主相对应的表述为“文中说In spleen, miR-143是组织特异的”,但不知道楼主在这点上理解是否有偏差。个人认为在某一种或仅在某几种组织中表达都应认为是组织特异性的表达。
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