转录因子研究——为论文加“分”

● 转录因子（Transcription factor，TF）是一类能与特异性DNA序列结合并调节基因转录的调控蛋白。

● 转录因子通常是细胞内信号通路的核心蛋白，是将外界刺激转化为基因表达变化的关键调控者。

● 人体的35000多个基因在不同的组织、不同的时间具有表达差异性，转录因子的调控起到重要的作用。

● 2012年的诺贝尔生理学或医学奖得主山中伸弥，在小鼠成纤维细胞中表达Oct3/4、Sox2、c-Myc以及Klf4四种转录因子，将成纤维细胞逆转形成多能干细胞（iPS）。

● 转录因子与多种人类重大疾病相关，比如p53、myc、ER、Id与癌症相关；MEF2、HIF1与心脏疾病相关；NFκB与炎症相关；PPAR与肥胖相关等等。

怎样用转录因子研究为论文加“分”？

加“分”Step 1

● 信号通路以及疾病相关的研究比较容易找到转录因子研究的突破口，已有在研项目的研究人员根据自身的研究背景，找准转录因子研究突破口。

● 对于还没有具体研究思路的科研人员来说，转录因子研究相对来说容易出结果、容易发文章，也容易进行深入地探索。

加“分”Step 2

● 转录因子种类繁多，研究比较多同时也是比较关键的转录因子大约有100种。

● 可以使用基因芯片，可以同时做很多目标蛋白的表达，但是相对来说面比较广，不会专门针对转录因子，后期数据分析以及后续目标选择方面比较困难。

● 推荐一种专门做转录因子的小高通量方法——“多重转录因子微孔板阵列检测试剂”。这个试剂专门做转录因子的，以标准96孔板微为载体，可以同时检测48/96种转录因子表达情况，操作过程跟ELISA实验差不多，结果数值化呈现，判读更直观、分析更简单。用这个做就更有针对性一点，只做常见的转录因子，后续的实验安排也更有针对性。

加“分”Step 3

● 高通量筛查后，通常要对表达差异的转录因子进行验证。

● 验证方法很多，包括转录因子滤板法、EMSA、ELISA以及荧光素酶报告载体等。

● 特别推荐一种适用于大量样本检测的“转录因子滤板法检测试剂”，一次实验可以检测96个样本中的转录因子表达，也可以根据需求灵活调整样本数量。

加“分”Step 4

● 到Step 3，就可以出一篇文章了，想发表高“分”文章还需要更多深入研究。

● 比如，向上游寻找转录因子差异表达的信号传导途径，或者向下游探索转录因子靶基因表达变化的影响。

● 还可以通过增大样本量、样本种类来提高文章水平。

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