肽的溶解性及溶解方法
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肽的溶解性
根据经验，溶解肽是一个很重要的环节。如果溶解不当可能导致肽损失或者实验失败。肽的溶解性主要取决于肽的序列，所以，如果实验允许，肽序列中至少应包含20%的带电残基以增加其溶解度。
在使用之前，客户可以遵循以下三个基本原则来选择合适的溶剂溶解多肽。首先，所选溶剂一定能充分溶解多肽。其次，所选溶剂能与实验条件兼容，最后，所选溶剂不能与肽反应，也不能使肽降解。只要肽的量允许，可以先用少部分肽溶解，然后再将全部样品溶解。如果需要从溶剂中回收肽,可以选择一种初始溶剂使其在冻干后容易去除。
以下建议或许对您溶解肽有所帮助：
1. 少于5个氨基酸的肽一般溶于水溶液，强疏水的氨基酸（W，I，L，F，M，V，Y）除外。
2. 如果带电氨基酸平均分布于全部序列中，那么含有＞25%带电氨基酸（E，D，K，R，H）的亲水肽和含有＜25%疏水氨基酸的肽一般都能溶于水溶液。多肽的纯化系统一般为0.1%TFA/水和0.1%TFA/CAN。
因此，如果肽溶解在没有缓冲能力或者缓冲能力很弱的缓冲液中，结果可能导致肽溶液呈酸性。在使用别的方法溶解肽时务必使溶剂的pH值近乎中性。酸性肽（E+D残基数多于K+R+H残基数）和碱性肽（K+R+H残基数多于E+D残基数）在中性pH值条件下比在酸性pH值下更易于溶解。
3. 疏水氨基酸含量为50%～75%的肽，即使序列中含有25%带电氨基酸也有可能不溶于水或者部分溶解。
最好先把肽溶于最少量的强溶剂（如：DMF，ACN，异丙醇，乙醇，乙酸，4-8M GdnHCl或尿素，DMSO（序列中没有C，W，M时)，及其它类似的有机溶剂，最好将溶解肽的有机溶剂缓慢地逐滴加入水溶液中。如果溶液变浑浊，可能是达到了溶解极限，继续溶解就没什么用了。需要注意的是，最开始选择的溶剂应该与实验系统兼容。
4. 疏水氨基酸含量＞75%的强疏水肽一般也不溶于水溶液。此类肽也应该先用强溶剂（如：TFA，甲酸）溶解，如果将其加入到水溶液中也可能产生沉淀。最后的肽溶液可能需要高浓度的有机溶剂使之变性，而有机溶剂一般不用于活细胞的生物功能研究。
5. S，T，E，D，K，R，H，N，Q，Y含量高（＞75%）的多肽序列容易形成多余的分子间氢键网络，在浓的水溶液中容易形成凝胶。此类肽可以用步骤3所述方法溶解。
为了减少溶解中可能出现的问题，建议从设计上和序列上多考虑，以改善肽的溶解度。
肽的溶解方法
用哪种溶剂溶解合成肽一直是困扰多肽工作者的一个难题。根据不同的氨基酸序列，可以参考以下方法来溶解合成肽。最好是先将少量肽用水溶液溶解，不要一次将全部样品都溶解掉。
1. 将酸性氨基酸Asp (D)，Glu (E)和C端-COOH.的值定为-1。
2. 而将碱性氨基酸Arg (R)，Lys (K)，His (H)的值定为+1。
3. 计算肽中全部电荷量。
4. 如果肽的全部电荷为正值，则肽呈碱性,可以先用水溶解。如果肽不溶于水，可以用10%乙酸或者更高浓度的乙酸溶解。如果肽一点都不溶，加入TFA(<50 ul)助溶,并用去离子水稀释至1ml。
5. 如果肽的全部电荷为负值，则肽呈酸性，可以先用水溶解。如果肽不溶于水，，加入NH4OH(<50 ul) 助溶，并用去离子水稀释至1 ml。
6. 如果肽的全部电荷为0，则肽呈中性。中性肽需要用乙腈、甲醇、异丙醇等有机溶剂来溶解，也可以加入变性剂（如：尿素、盐酸胍等）。
实例：
KRLMKSIEVIMPL: (+3) + (-2) = +1。此条肽呈碱性。见以上步骤4。
LVKMKSIEDPDCE: (+2) + (-5) = -3。此条肽呈酸性。见以上步骤5。
MVSRKDLVEHRDM: (+4) + (-4) = 0。此条肽呈中性。见以上步骤6。
