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【交流】质粒大抽心得

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21063

最近做大抽,用的是Qiagen Maxi kit, 一开始抽提产量少,因为是公认的昂贵而好用的试剂盒,觉得是自己操作的不好。就仔细研究了说明书,及整个提取过程,得出一些经验。(high copy plasmid)

1.摇菌:菌摇得好不好十分重要。整个过程,其他步骤完全按试剂盒说明操作,一般没有问题,唯独摇菌得自己操作。

a.个人觉得还是先活化摇菌8h,在稀释后扩大培养较好,不要偷懒。

b.摇菌量问题:试剂盒有推荐cultrue volume,我的推荐100ml,对此我反复思索后,才明白原因:我用的柱子质粒DNA最大吸附量为500ug ,而一般培养1ml菌液可得5ug质粒,因此推荐摇菌量为100ml 。

我们知道摇菌量太多或者太少,都会影响结果,菌量太少,发现加P3后,离心,沉淀物仍漂起,有的黏附在管壁上,上清一点都不澄清。

原因是,菌量太少,以至于碱裂解后,SDS缺乏菌体蛋白和DNA 缠绕,只形成盐沉吸,故而无法离心下去。菌量太多,碱裂解不足,影响结果。

那么,到底多少比较合适呢?我按推荐量操作,出现菌量太少的情况。于是我培养到200ml ,这个量不会造成碱裂解不足。而且可以得到双倍产量。

c.抗生素,Amp较Kana 难控制,摇菌时间太长,浓度会下降很快。用的时候,加入量太多,又抑制细菌繁殖,菌量少。所以用Amp得时候,最好摸索一下最佳使用浓度和摇菌时间。

2 离心转速:说明书有时说的20000g或者15000g,有些实验室离心机达不到转速的,稍微低一点,不如12000g ,没有什么关系,或者7500g,时间延长也可以的,不必过于刻板。

3. 异丙醇沉淀:我们实验室老师们都改用无水乙醇沉淀,认为沉淀更可见。我用异丙醇,沉淀照样很明显,也不是特别松散,还是清晰可见的,如果要保险一点儿,可以离心前在管子上做好标记,这样就知道离心后沉淀的位置了。只是要特别注意,去上清时,千万不要把沉淀给倒了,不然就全白费了,money+time+energy!!!

一次得双倍产量的做法:理论上 100ml 菌 ----- 500ug plasmid DNA

200ml ------- 1000ug plasmid DNA 。

由于柱最大容量为500ug ,我们只需重新吸附+洗脱一次即可。具体做法:

1,200ml 菌量。第一遍按常规操作,但是要分别收集过柱吸附后的液体,记为A 液;收集两次漂洗后液体,记为B液(因为要做两次,这次漂洗液可以适量减少点,省下来,用于二次:D)其余继续作,得到沉淀,完成后,自此我们获得大概500ug DNA 。

千万不要扔掉A、B 液,因为里面还有大概500ug DNA

2.将A 液倒入柱子(不需要换柱子,还是用刚才用过那个),此过程即重新吸附,弃过柱液,倒入B液,相当于吸附+漂洗了,当然现在可弃过柱液了,再加入适量漂洗液(就加第一次省下的量即可),加入洗脱液,按步骤继续,又能得到500ug 左右DNA

我计算用的试剂液量,也就洗脱液多用5ml,其余跟一次大抽用量一样,这样有不浪费试剂,又可以得到双倍产量,本人得到1200ug ,分光光度计检验260、280等,两次基本相同。这样做并不影响第二次得到的plasmid DNA质量

最后,以上为个人经验,仅供参考,一定要熟读试剂盒说明书,理解抽提过程每一步含义后,方可灵活应用,建议初学者还是严格按照说明书步骤:)

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