生物标志物研究与早期药物研发基因表达分析功能学检测

RealTime ready应用指南June 2011

 

生物标志物研究与早期药物研发基因表达分析功能学检测

RealTime ready 应用

 

Sabine Lohmanundefined, Andrea Herolundefined, Tobias Bergauer#, Anton Belousov+, Gisela Betzundefined, Manuel Dietricundefined, Manuela Poignée-Hegeundefined, David Geho’, Martin Weisser+ 

 

~undefinedRoche Applied Science, Penzberg,德国

+ Roche Pharma, Penzberg,德国

# Roche Pharma, Basel,瑞士

’Roche Pharma, Nutley,美国

 

生物标志物与早期临床药物研发抗-TWEAK复合物研发举例TWEAK（肿瘤坏死因子样细胞凋亡弱诱导因子）是一种多功能细胞因子，可控制包括细胞增殖、迁移、分化、凋亡、血管生成，以及炎症在内的多种细胞活动。TWEAK通过与Fn14结合发挥作用，Fn14 是一种具有高度诱导性的细胞表面受体，与包括细胞核因子-kB（NF-kB）途径在内的多种细胞内信号途径具有相关性。

 

根据文献搜索与TWEAK信号转导途径生物学芯片数据，应用“关键词”搜索功能，于RealTime ready配置门户网完成一个RealTime ready NF-kB定制型多孔检测板的配置。为生成首个假设，使用RealTime ready NF-kB panel，于9种不同的肿瘤细胞系（经过处理细胞系对未处理细胞系，于不同时间点，共使用 54 份样本）中，进行体外基因表达分析。根据细胞系结果，使用简化NF-kB panel（35种参数），确认体内小鼠移植模型中的潜在生物标志物。基于细胞系与移植物测定结果，鉴定出13种潜在性、候选基因。为对假设进行检验，从上述参数中筛选出6种参数，进行人FFPE样本分析。上述6种参数与所选参考基因适合于感兴趣的实体肿瘤（BC、CRC、NSCLC、肉瘤、RCC）。已经开发出RealTime ready qPCR检测，并已经进行FFPET RNA分离功能的优化。

下载具体指南
http://www.biomart.cn/upload/ppt/2011Roche/Roche-RTR——2011.pdf