没有IRT的DNA样品或许会很脏

很多研究者因样品DNA很脏，转而求助于我们。问题样品主要集中在土壤、粪便和血液。样品富含腐植酸、多糖类、亚铁血红素和色素等，与DNA交联严重抑制下游PCR扩增等酶实验和测序。MO BIO拥有一项专利抑制因子去除技术^®（IRT），应用在多款试剂盒上能高效去除抑制因子却极少影响DNA得率。这项技术真的有用吗？负责任的研究者需要看到实验数据。最近我们接到下面的一个问题：

Q：你们有使用与不使用抑制因子去除技术^®（IRT）提取DNA的质量对比数据吗？

答案是有的。我们已经做了一系列的质量评估工作，证明了提取环境样品DNA的过程中使用IRT技术的重要性。一篇总结性文章曾发表于ASM 2010年年会（可致电：0755-8348 9872索取）。使用含IRT技术的MO BIO PowerSoil^® DNA Isolation Kit，与不含IRT技术的竞争品牌试剂盒，提取0.1g堆肥做对比试验。最终DNA用分光光度法和凝胶电泳分析作初步分析，然后用通用引物16S rRNA，KAPA2G Fast HotStartReadymix酶跑end-point PCR。下图（图3A）展示DNA纯度曲线和凝胶电泳结果。图3B展示最终DNA的吸光值。值得注意的是，竞争对手试剂盒提取的DNA A260读数较高，表面上看起来得率是PowerSoil^® Kit（P）的两倍，然而进一步的凝胶电泳能看到多出部分的DNA源于大量腐植酸污染（低230/260比值加上高340读数，图3B），以及回收的大量降解RNA（图3A）。后面的PCR扩增再次确认存在抑制因子。

 

再来一个实验对比我们的两款试剂盒效果；一款含IRT技术（PowerWater^®），另一款不含IRT技术（RapidWater^®）。除了IRT技术，其它都一样。图4A展示最终DNA得率差不多，而使用IRT技术的DNA Real-time PCR结果Cq值更低和划一。

光肉眼是看不出DNA脏与不脏的！就这个水样DNA来说，尽管分光光度法测纯度表明很干净，结果qPCR结果还是非常不能令人满意。

虽然不是说有的样品像这个水样一样棘手，但是无论你做的是什么类型样品，MO BIO总有方法提取它。有了IRT技术，扩增成功率更有保障！

MO BIO的DNA和RNA提取试剂盒中，下列产品使用了IRT技术：PowerBiofilm^®、PowerSoil^®、PowerMax^®、PowerPlant^®、PowerClean^®、PowerWater^®、PowerFood^® 及BiOstic^®Bacteremia DNA Isolation Kit。