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手把手教你如何查找启动子?

生物学霸

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和大家分享一下如何在新版 ensemb 查找启动子。

首先,选择物种,输入基因名。

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比如: 搜索小鼠 Ptgs2 后,点击红圈处。

点击红圈:

点击 exons:

5' upstream sequence 绿色部分为启动子所在位置,紫色部分是非编码区,黑色部分是编码区,蓝色区为内含子。但他所给的 5' upstream sequence 只有 50 bp,怎么办呢? 屏幕左边有个 configure this page,点击:

更改数字 save and close,即可看到你想要的结果:

Ensembl 除了可以用来克隆启动子,还可以很直接的了解一个基因多个转录本的转录起点、SNP、蛋白信息等等,还有很多有用的地方。

文章作者:丁香园站友@ zhao22840718

图片来源:丁香园论坛


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