手把手教你如何用 Sign 工具分析信号通路里基因间的关系

今天小编给你们讲这个用来分析信号通路间联系的神奇工具——Sign ：

我们就随便搜一个P53：

结果就是这样一个复杂的信号通路图：

告诉你涉及的信号通路，以及基因信息，还有就是基因间的关系。实际上这些关联性，一是靠数据库的分析，二就是靠文献分析获得的，所以有的关联并不是那么牢靠。所以提高一点关联性分数来筛选的话，可以去掉一大批乱七八糟的 Node：

往下拉，下面就是这种关联所代表的含义，比如上调 P53 的乙酰化、磷酸化等等……

这也是可以筛选的（比如我选了个磷酸化/上调）：

当然，这个关联分析的工具里，不光包含了基因，比如我搜一个 STAT，就会出现类似名字的化合物：

还能搜到 JAK/STAT 信号通路：

上次给你们讲 JAK/STAT 信号通路的时候，有人问，STAT 的磷酸化位点不是 727 么？为什么小编只说 705？

我们可以看一看 STAT 的关联图：

在这个关联图下面，有相对应的 STAT 常见磷酸化位点，以及对这几个位点进行磷酸化的基因：

你们可以看到在 JAK/STAT 里，JAK 对于 STAT 的磷酸化位点就是 705，而 727 是由 MAPK 以及 mTOR 对其磷酸化的位点。

还有人问了，不是还有 701 吗？小编还是没说！

对，是有 701，因为 JAK/STAT 里包含了两种 STAT——STAT3 和 STAT1，常用的是 STAT3，磷酸化位点是 705 和 727。

而 STAT1 的话：

磷酸化位点就变成了 701 和 727 了……

好了，用了这个工具的话，就大概会对信号通路有个初步的了解了吧~