9.11 Nat Commun：乳腺癌基因 GREB1 有望成为开发肝母细胞瘤靶向性疗法的潜在靶点

① Nat Commun：乳腺癌基因 GREB1 有望成为开发肝母细胞瘤靶向性疗法的潜在靶点

近日，一项刊登在国际杂志 Nature Communications 上的研究报告中，来自大阪大学的科学家们基于此前研究在理解肝母细胞瘤发病原因上取得了重大进展，研究人员鉴别出了一种关键基因，有望帮助后期开发治疗肝母细胞瘤的新型疗法。

研究人员对肝脏肿瘤细胞中不典型的 Wnt/β-连环蛋白靶点基因进行筛选来识别在肝母细胞瘤发生过程中扮演关键角色的新型基因，其中一个表达量最丰富的基因就是乳腺癌雌激素调控蛋白 GREB1（growth regulation by estrogen in breast cancer 1），其是一种能够参与乳腺癌细胞生长的雌激素效应基因。

未来研究人员有望利用 GREB1 靶向性疗法来特异性的靶向抑制肝母细胞瘤，从而治疗患者并改善患者的生活质量。

原文检索：GREB1 induced by Wnt signaling promotes development of hepatoblastoma by suppressing TGFβ signaling

② Science 子刊：激活蛋白 TREM2 有望延缓阿尔茨海默病进展

在一项新的研究中，来自德国神经退行性疾病中心和慕尼黑大学医学中心卒中与痴呆研究所等研究机构的研究人员发现一种命名为 TREM2 的蛋白可能对阿尔茨海默病的病程有缓解作用。

他们发现在这种疾病的不同阶段，脑脊液中 TREM2 水平较高的患者要比脑脊液中 TREM2 水平较低的患者具有更好的预后。

这一结果为开发新的治疗策略提供了起点。

原文检索：Increased soluble TREM2 in cerebrospinal fluid is associated with reduced cognitive and clinical decline in Alzheimer’s disease

③ Nature 子刊：新一代单细胞 itChIP 技术解析早期胚胎细胞命运决定机制

染色质免疫共沉淀（ChIP-seq）技术是捕获蛋白质-DNA 相互作用的有效手段，然而目前单细胞 ChIP-seq 技术仍面临诸多挑战，极大限制了人们对细胞命运特化的调控机制的认识。

2019 年 9 月 3 日，北京大学分子医学研究所、北大-清华生命科学联合中心何爱彬组利用一种全新的普适性，易操作的单细胞 ChIP-seq 技术解析早期胚层和器官发育中细胞命运的选择决定机制，并将这一方法命名为 itChIP（simultaneous indexing and tagmentation-based ChIP-seq）。

该工作首次解析了小鼠胚胎干细胞退出全能性，向三个胚层分化过程中的表观调控时空规律。同时，通过整合单细胞转录组和单细胞 ChIP-seq 数据，研究者揭示了心脏干细胞向心肌和内皮细胞分化过程中细胞类型特异性增强子对细胞命运决定的调控机制。

原文检索：Profiling chromatin state by single-cell itChIP-seq

④ Nat Commun 鉴别出一种能调节多种癌症发生发展的关键分子！

日前，一项刊登在国际杂志 Nature Communications 上的研究报告中，来自 Josep Carreras 白血病研究所的科学家们通过研究发现，非编码基因组的特殊区域所表达的一种中间性分子或许对于细胞的发育、分化以及肿瘤细胞的扩展至关重要。文章中，研究者揭示了名为 RPSAP52 的 RNA 分子诱发细胞增殖并取消细胞分化的分子机制，这或许能够帮助肿瘤细胞进行增殖和扩散。

RPSAP52 是一种反义转录物，其能调节 HMGA2 /IGF2BP2 /RAS 信号通路，该信号通路具有高度的促增值和抗分化潜能，其激活能够促进细胞的生长并将细胞维持在一种非分化的状态，而这常常是在恶性肿瘤细胞中所出现的状况。

目前研究人员已经在乳腺癌和肉瘤中证实了 RPSAP52 的致瘤角色，同时其还能作为一种非常有价值的生物标志物。

原文检索：The transcribed pseudogene RPSAP52 enhances the oncofetal HMGA2 -IGF2BP2 -RAS axis through LIN28B-dependent and independent let- 7 inhibition

⑤ Cell：长期存在的细胞发育难题终破解！揭示神经嵴细胞在胚胎发育早期清除死亡细胞

处于胚胎阶段的有机体还没有发育出巨噬细胞和免疫系统。它们是随后在有机体的进一步发育过程中产生的。那么在巨噬细胞出现之前，死细胞是如何被清除的呢？这是发育生物学家长期以来提出的一个老问题。

如今，在一项新的研究中，来自美国弗吉尼亚大学的研究人员描述了他们发现的一个过程：神经系统的胚胎细胞-神经嵴细胞（neural crest cell）-在斑马鱼发育的较早阶段执行死细胞清除任务。

研究者计划在未来的研究中阻止神经嵴细胞吞食，以便观察下游的生理效应是什么。这可能为发育障碍提供新的见解，包括那些影响神经系统的发育障碍，在这些发育障碍中，碎片清除可能无效地或在错误的时间进行，从而导致功能障碍。

原文检索：Migratory Neural Crest Cells Phagocytose Dead Cells in the Developing Nervous System

⑥ PNAS：科学家鉴别出新型癌症驱动基因

长期以来，科学家们一直在寻找促进癌症进展的驱动子基因，但当前技术很难将真正的驱动突变与其它只是简单的「乘客」突变区分开来，这些突变并不直接参与肿瘤的扩散。

如今研究人员开发了一种能将生物物理学、先进的基因测序技术和统计学方法相结合的新模型，其能够帮助研究者鉴别出至少 200 个驱动癌症进展的新型基因。

后期研究人员还将继续深入研究来发现更多驱动癌症进展的关键基因，从而为开发有效的抗癌疗法提供新的思路和线索。

原文检索：Leveraging protein dynamics to identify cancer mutational hotspots using 3D structures

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