酵母中的非生产性转录
测量mRNA丰度的研究,例如那些使用微阵列的研究,经常被用作基因表达的转录控制的代理。然而,给定mRNA在任何时候的数量都是其产生和降解之间的平衡。在最近发表在《基因组生物学》(Genome Biology)上的一篇文章中,麻省大学(University of Massachusetts)的奥利弗·兰多(Oliver Rando)和同事们发现,mRNA的丰度并不总是与基因上RNA聚合酶的数量相关,因此mRNA的丰度并不总是一个很好的转录活性指标。
兰多和他的同事将酵母细胞暴露在两种不同的压力下。然后他们用微阵列和染色质免疫沉淀法测定mRNA的丰度和PolII定位。
一般来说,PolII丰度确实能解释mRNA丰度,但也有基因显示每个PolII分子mRNA过剩或缺失。有趣的是,在许多情况下,这些基因也表现出非生产性转录——非编码基因的转录与编码基因重叠。
兰多的结论是,不参与正常生长的基因显示非生产性转录,但当细胞受到压力时,聚合酶转移到基因的5 '端,根据需要进行转录。
因此,这项研究不仅阐明了mRNA水平如何与PolII活性相关,还揭示了通过非生产性转录调控基因表达的潜在新途径。