告辞,我原来就只是想搜个文献,但为啥会有搜出来这些信号通路和RNAseq结果……
其实我原来就想搜个文献,只是换了个搜文献的方法……嗯,这次用类似GO分析的本体论结构,来进行文献的搜索,用的就是这个:
实际上,这是个RGD研发的文本挖掘搜索工具,平时大家也都是随便搜搜关键词,这次可以按照MeSH词并且通过MeSH词的本体论分类来筛选出更多的关键词:
比如搜索基因,就搜一个P53看看:
会显示出所有有P53字段的基因,直接搜索。搜索获得的文献,会按照不同的分类,来进行文章文本的MeSH词分类,并且在旁边还能用MeSH词来筛选:
当然,你可以随意点击一个文献中包含的MeSH词,比如成纤维细胞,大概就会得到一个这样的解释:
并且会对MeSH词的本体论路径进行分析:
如果点开“凋亡执行程序”,甚至会显示相关基因在染色体上的位置:
以及这些基因实际的相关信息:
然后点进另一个基因分析的数据库,甚至能分析这些基因的转录因子结合位置,以及RNAseq结果柱状图,等等:
甚至还能分析基因相关的信号通路……
呃,对了,我刚开始是要干啥来着……好像只是要查查看文献……