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Nature​:肿瘤和免疫细胞抢「蛋」?邹伟平谈肿瘤影响T细胞代谢和功能新机制

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采访内容编译自密歇根大学宣传稿

甲硫氨酸又叫蛋氨酸,是构成人体的必需氨基酸之一。除了参与蛋白质合成外,蛋氨酸还在蛋白质、DNA 等的甲基化中起到重要作用。

曾经有研究报道低蛋氨酸饮食可抑制小鼠肿瘤 (1),而最近的这项研究发现,肿瘤还会和 T 细胞「抢」蛋氨酸,单纯靠饮食抑制蛋氨酸可能是把「双刃剑」。

图片来源:站酷海洛 Plus

2020 年 9 月 2 日,来自密歇根大学医学院的邹伟平团队Nature 上在线发表了题为 Cancer SLC43A2 alters T cell methionine metabolism and histone methylation 的研究成果 (2)该研究发现肿瘤细胞竞争性摄取蛋氨酸会抑制 T 细胞的功能,靶向肿瘤中蛋氨酸信号可能免疫治疗提供新方法。


图片来源:Nature



研究内容


肿瘤细胞「抢走」T 细胞的蛋氨酸


为了检测异常氨基酸代谢是否与 T 细胞中组蛋白的改变和功能障碍有关,作者用单独不含某种氨基酸的培养基培养小鼠 CD8+ T 细胞,发现蛋氨酸的缺失导致最明显的 T 细胞死亡和功能障碍。进一步地,作者发现肿瘤细胞会显著降低培养基中的蛋氨酸浓度,进而抑制 CD8+ T 细胞的功能


图片来源:Nature


蛋氨酸是如何影响 T 细胞功能的?


为了研究肿瘤细胞通过剥夺蛋氨酸影响 CD8+ T 细胞的机制,作者分别用新鲜培养基、肿瘤细胞上清液、添加蛋氨酸的肿瘤细胞上清液培养 CD8+ T 细胞,并对其进行 RNA-seq 测序。

基因集富集分析(GSEA)显示,在肿瘤细胞上清液中培养的 CD8+ T 细胞中,凋亡特征显著富集,而 T 细胞受体信号和 蛋氨酸代谢信号则降低。


图片来源:Nature

接下来,作者进行了平行的 CD8+ T 细胞的代谢组学分析,发现肿瘤上清液中培养的 CD8+ T 细胞显示细胞内蛋氨酸,S - 腺苷甲硫氨酸(SAM)显著减少。

细胞内蛋氨酸可转化为 SAM,SAM 为表观遗传甲基化的供体。因此,作者检测了 T 细胞组蛋白标记,发现肿瘤细胞上清液培养可诱导 T 细胞组蛋白 H3K79me2 显着降低。此外,补充蛋氨酸或 SAM 可恢复减少的 H3K79me2。

因此,肿瘤细胞对蛋氨酸的限制会减少甲基供体 SAM,进而损害 CD8+ T 细胞中的 H3K79me2


图片来源:Nature

那么 H3K79me2 的丧失又是如何导致 T 细胞功能障碍的呢?H3K79me2 是哺乳动物细胞中的活性基因的标记,出现在转录活性基因编码区的启动子和 5' 区域。

JAK–STAT 通路调节 T 细胞的存活和功能。在 JAK–STAT 通路的组成部分中,作者发现 Stat5 的表达受 H3K79me2 缺失的影响最大。ChIP 分析表明,CD8+ T 细胞 Stat5 启动子上存在高水平的 H3K79me2,在用肿瘤细胞上清液培养后减少,但补充蛋氨酸后可以恢复。因此,H3K79me2 参与了 CD8+ T 细胞中 STAT5 转录的直接调控。


图片来源:Nature

补充蛋氨酸可恢复 T 细胞抗肿瘤功能


作者向小鼠肿瘤中注射了蛋氨酸,发现补充蛋氨酸可延缓肿瘤的生长,并可增强肿瘤浸润性 CD8+ T 细胞中 H3K79me2 以及 STAT5 的表达,提高 T 细胞存活率和细胞因子的表达。此外,蛋氨酸和 PD-L1 单抗还能起到协同的抗肿瘤作用。为结直肠癌病人补充蛋氨酸也能观察到类似的结果。

图片来源:Nature

肿瘤细胞是如何「抢夺」蛋氨酸的?


蛋氨酸通过溶质载体家族(SLC)转运到细胞中,该家族包括系统 L 型和 A 型转运蛋白。作者用系统 L 型或系统 A 型转运蛋白的抑制剂处理肿瘤细胞,并用其上清培养 CD8+ T 细胞。结果发现,系统 L 型(而不是 A 型)转运蛋白的抑制剂可以防止 T 细胞的凋亡和功能受损。因此,系统 L 转运蛋白可能与肿瘤消耗蛋氨酸有关。

接下来,作者比较了效应 CD8+ T 细胞和几种肿瘤细胞中的 SLC 转录本,发现系统 L 转运蛋白 SLC43A2 在肿瘤细胞上的表达相对较高,提示肿瘤细胞可能通过 SLC43A2 在蛋氨酸摄取方面优于 T 细胞


图片来源:Nature

为了验证这一点,作者干扰了肿瘤细胞中 SLC43A2 的表达,发现用干扰 SLC43A2 表达的肿瘤细胞上清培养 CD8+ T 细胞,T 细胞凋亡减少、多功能性细胞因子表达增强。

进一步的实验表明,靶向肿瘤 SLC43A2 并结合免疫检查点抑制剂可发挥协同增强作用,因此可能是一种潜在的免疫治疗新方法


图片来源:Nature


研究总结


本研究表明肿瘤细胞 SLC43A2高表达使其在蛋氨酸摄取上相比 T 细胞竞争优势,从而在代谢和表观遗传上损害 T 细胞功能和抗肿瘤免疫能力

这项工作证实了肿瘤浸润 T 细胞中代谢、组蛋白模式和功能特征之间长期的相互作用。在此基础上,选择性靶向肿瘤蛋氨酸代谢可能是一种有效的肿瘤免疫治疗方法。


图片来源:Nature

鉴于肿瘤细胞对蛋氨酸的依赖性,先前的研究大多考虑用一种系统的方法来减少蛋氨酸。但根据本研究的结果,这种做法可能是把双刃剑

肿瘤细胞和 T 细胞竞争蛋氨酸,如果通过减少蛋氨酸来「饿死」肿瘤细胞,那么 T 细胞也不会得到它。因此作者希望选择性地抑制肿瘤细胞的蛋氨酸,而不是 T 细胞的。


图片来源:密歇根大学罗杰尔癌症中心

据悉,邹伟平教授获得了美国国家癌症研究所(National Cancer Institute)的 320 万美元拨款,以推动这项工作的继续进行。

邹伟平教授表示:「我们还有很多机制细节尚未弄清,特别是蛋氨酸代谢的详细通路。我们还需要了解肿瘤细胞和 T 细胞的代谢通路有何不同。我们希望找到一个靶点,相对于肿瘤细胞特异,这样就不会伤害 T 细胞,而是会影响肿瘤。」这项工作将成为新拨款的研究重点。

此外,他还将与药物专家合作,以试图确定一种靶向肿瘤细胞中蛋氨酸的小分子抑制剂
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