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利用 M13 噬菌体进行体外基因定点突变

相关实验:体外基因定点突变

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简介

利用 M13 噬菌体进行体外基因定点突变是在含有目的基因的 M13 单链噬菌体 DNA 复制过程中引入突变引物,使得新合成的 DNA 序列发生定点突变,经克隆测序获得突变体。


原理

利用 M13 噬菌体进行体外基因定点突变的基本原理是在含有目的基因的 M13 单链噬菌体 DNA 复制过程中引入突变引物,使得新合成的 DNA 序列发生定点突变,经克隆测序获得突变体。


材料与仪器

试剂:
M13 噬菌体、培养基、DNA 聚合酶、
仪器:
PCR 仪、培养箱、测序平台


步骤

利用 M13 噬菌体进行体外基因定点突变的基本过程包括以下几步:
(1)目的基因的克隆:将目的基因(通常<500bp)克隆到适当的 M13 噬菌体载体,如 M13mpl8/M13mpl9 等(该系列噬菌体克隆载体可用蓝白筛选)。挑单个噬菌斑扩增培养,提取双链 DNA 进行酶切鉴定。将插入了目的基因片段的噬菌斑用于定点突变。
(2)定点突变引物的设计:按照拟突变的位点设计并合成定点突变引物。该引物在用于单链噬菌体 DNA 合成之前,需用 T4 多核苷酸激酶使其 5'-端磷酸化。
(3)噬菌体单链 DNA 的纯化:M13 噬菌体在复制过程中产生单链环状 DNA,并被包装为噬菌体颗粒,从细菌中分泌出来,所以单链 DNA 存在于培养上清中。此步骤的目的是获得含有目的基因的 M13 噬菌体单链环状 DNA。
(4)突变引物引导噬菌体 DNA 的合成:首先使突变引物与噬菌体 DNA 退火。使用步骤 3 获得的单链 M13 噬菌体 DNA,将磷酸化的突变引物和 M13 通用测序引物与之混合。先加热至突变引物 Tm 值 20℃ 以上,再缓慢降至室温。模板 DNA 用 0.5 pmol/L(约lµg),磷酸化的突变引物和通用引物(与突变引物在同一方向)均用 10 pmol/L,反应体积为 10µ1。在完成退火的模板和引物 DNA 中,加入 10µ1DNA 聚合酶 Klenow 反应混合体系充分混匀后于 16℃ 孵育 12 小时。转化大肠埃希菌 TGl,按噬菌体操作方法铺板。对噬菌体克隆进行鉴定及测序,最终获得突变克隆。


来源:丁香实验

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