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方案5 用 μLC-ESI-MS/MS 对磷酸化多肽进行分析

相关实验:用蛋白质组学方法绘制磷酸化位点图谱

最新修订时间:

材料与仪器

IMAC 柱子上洗脱下来的多肽
乙酸 七氯丁酸 乙腈
HPLC 系统 质谱仪 micro-ESI 接口 micro-LC 柱

步骤

1.根据制造商的建议,制备、清洗、平衡 uLC 柱。

柱子的流速决定于柱子本身,一般 50um (内径)的柱子为 200nl/min 左右,100um (内径)的柱子则为 500nl/min 左右。通过调节毛细管前方的 T 形分离装置中的毛细管的长度(靠经验确定)进行分流,从而实现对流速的控制。这一装备可用于一般的 HPLC 泵,如能把流速控制在 0.5~4.Oml/min 范围,就可用于毛细管柱的操作。

2.加蛋白质样品(见方案 4 第15 步)到 uLC 柱上。

3.用 0~60% 的线性梯度溶液 B 洗脱,洗脱多肽 50 min 以上,从柱子上洗脱下来的多肽通过 micro-ESI 接口引入 MS。

4.而后对多肽进行 CID 分析,借助 MS 进行片段化选择使用自动化的数据依赖型 MS/MS 程序,该程序在绝大多数 MS 控制软件包中均可选择使用。

来源:丁香实验

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