原理
同 Chomczynski 和 Sacchi 两人于 1987 年报道的 RNA 快速提取法一样,这种方法包括用含异硫氰酸胍和酚的一种单相液来裂解细胞。加入氯仿产生了第二相(有机相),DNA 和蛋白质在有机相中被抽提,RNA 则被留在上层水相中。
材料与仪器
源细胞或组织
氯仿 乙醇 异丙醇 液氮 单相裂解试剂 磷酸缓冲盐溶液 RNA 沉淀液 乙酸钠
Sorvall H1000 转头或与之相当的转头 Sorvall SS-34 转头或与之相当的转头 比色杯 匀浆器 研钵和研杵 带螺帽的聚乙烯管 水浴
氯仿 乙醇 异丙醇 液氮 单相裂解试剂 磷酸缓冲盐溶液 RNA 沉淀液 乙酸钠
Sorvall H1000 转头或与之相当的转头 Sorvall SS-34 转头或与之相当的转头 比色杯 匀浆器 研钵和研杵 带螺帽的聚乙烯管 水浴
步骤
一、材料
1. 缓冲液和溶液
氯仿
乙醇
异丙醇
液氮
单相裂解试剂
磷酸缓冲盐溶液(PBS), 冰冷
RNA 沉淀液(1.2 mol/L NaCl,0.8 mol/L 柠檬酸二钠盐·15H2O(不需要调 pH)
乙酸钠(3 mol/L, pH 5.2)
2. 细胞和组织
源细胞或组织
3. 离心机和转头
Sorvall H1000 转头或与之相当的转头
Sorvall SS-34 转头或与之相当的转头
4. 专用设备
测量 260 nm 吸光度的比色杯
匀浆器(如Tekmar-Dohrmann 的组织匀浆器和 Brinkmann 的 polytron 匀浆器)
研钵和研杵
带螺帽的聚乙烯管
水浴,预设定 65℃
二、方法
1. 准备分离 RNA 的细胞或组织样品
(1) 组织
① 解剖所要的组织,将其直接放入液氮中速冻。
② 将 100 mg 冰冻组织放液氮的研钵中,用研杵碾碎组织。在研磨过程中要不断添加液氮以保持组织冷冻。
③ 将粉末状的组织移入一个盛有 1 ml 冰冷单相液的聚乙烯螺帽管中。
④ 于室温用 polymm 匀浆器高速匀浆组织 15~30s。
(2) 悬浮生长的哺乳动物细胞
① 用台式离心机于室温以 200~900 g(Sorvall H1000 转头为 1000~3000 r/min) 离心 5~10 min, 收集细胞。
② 吸出培养液,用 1~2 ml 无菌冰冷的 PBS 重悬细胞沉淀。
③ 离心收集细胞,吸尽 PBS, 每 106 细胞加 1 ml 单相裂解剂。
④ 于室温,用匀浆器高速匀浆细胞 15~30s。
(3) 单层生长的哺乳动物细胞
① 吸出培养液,用 5~10 ml 无菌冰冷的 PBS 洗涤细胞一次。
② 吸出 PBS, 每个直径 90 mm 培养皿中的培养细胞用 1 ml 单相裂解剂裂解细胞(每个直径 60 mm 培养皿加 0.7 ml 单相裂解剂)。
③ 转细胞裂解液于一螺帽聚乙烯管中。
④ 于室温用匀浆器高速匀浆细胞裂解物 15~30s。
2. 于室温将细胞匀浆物温育 5 min 使核蛋白复合物完全解离。
3. 加入 0.2 ml 氯仿于每毫升单相裂解剂中,通过剧烈摇动或用旋涡震荡器混匀样品。
4. 于 4℃ 以 12000 r/min (Sorvall SS-34 转头 10000 g)离心 15 min 使混合物分为两相, 将上层水相移至一个新的离心管中。
5. 从水相中沉淀 RNA: 每 1 ml 单相裂解剂,加入 0.25 倍体积的异丙醇和 0.25 倍体积的 RNA 沉淀液。充分混匀后,于室温放置 10 min。
6. 于 4℃ 以最大转速离心 10 min 收集 RNA 沉淀。用 75% 的乙醇洗涤沉淀两次,重复上述离心。用一次性使用的吸头吸尽残存的乙醇。将打开管盖的离心管在实验台放置几分钟,让最后残存的痕量乙醇挥发殆尽。不要让 RNA 沉淀干透。
7. 加 50~100 μl DEPC 处理过的水。将 RNA 溶液贮存于 -70℃。
加 SDS 至终浓度 0.5%,然后加热至 65℃ 有助于 RNA 沉淀的溶解。
8. 估计 RNA 的浓度。
1. 缓冲液和溶液
氯仿
乙醇
异丙醇
液氮
单相裂解试剂
磷酸缓冲盐溶液(PBS), 冰冷
RNA 沉淀液(1.2 mol/L NaCl,0.8 mol/L 柠檬酸二钠盐·15H2O(不需要调 pH)
乙酸钠(3 mol/L, pH 5.2)
2. 细胞和组织
源细胞或组织
3. 离心机和转头
Sorvall H1000 转头或与之相当的转头
Sorvall SS-34 转头或与之相当的转头
4. 专用设备
测量 260 nm 吸光度的比色杯
匀浆器(如Tekmar-Dohrmann 的组织匀浆器和 Brinkmann 的 polytron 匀浆器)
研钵和研杵
带螺帽的聚乙烯管
水浴,预设定 65℃
二、方法
1. 准备分离 RNA 的细胞或组织样品
(1) 组织
① 解剖所要的组织,将其直接放入液氮中速冻。
② 将 100 mg 冰冻组织放液氮的研钵中,用研杵碾碎组织。在研磨过程中要不断添加液氮以保持组织冷冻。
③ 将粉末状的组织移入一个盛有 1 ml 冰冷单相液的聚乙烯螺帽管中。
④ 于室温用 polymm 匀浆器高速匀浆组织 15~30s。
(2) 悬浮生长的哺乳动物细胞
① 用台式离心机于室温以 200~900 g(Sorvall H1000 转头为 1000~3000 r/min) 离心 5~10 min, 收集细胞。
② 吸出培养液,用 1~2 ml 无菌冰冷的 PBS 重悬细胞沉淀。
③ 离心收集细胞,吸尽 PBS, 每 106 细胞加 1 ml 单相裂解剂。
④ 于室温,用匀浆器高速匀浆细胞 15~30s。
(3) 单层生长的哺乳动物细胞
① 吸出培养液,用 5~10 ml 无菌冰冷的 PBS 洗涤细胞一次。
② 吸出 PBS, 每个直径 90 mm 培养皿中的培养细胞用 1 ml 单相裂解剂裂解细胞(每个直径 60 mm 培养皿加 0.7 ml 单相裂解剂)。
③ 转细胞裂解液于一螺帽聚乙烯管中。
④ 于室温用匀浆器高速匀浆细胞裂解物 15~30s。
2. 于室温将细胞匀浆物温育 5 min 使核蛋白复合物完全解离。
3. 加入 0.2 ml 氯仿于每毫升单相裂解剂中,通过剧烈摇动或用旋涡震荡器混匀样品。
4. 于 4℃ 以 12000 r/min (Sorvall SS-34 转头 10000 g)离心 15 min 使混合物分为两相, 将上层水相移至一个新的离心管中。
5. 从水相中沉淀 RNA: 每 1 ml 单相裂解剂,加入 0.25 倍体积的异丙醇和 0.25 倍体积的 RNA 沉淀液。充分混匀后,于室温放置 10 min。
6. 于 4℃ 以最大转速离心 10 min 收集 RNA 沉淀。用 75% 的乙醇洗涤沉淀两次,重复上述离心。用一次性使用的吸头吸尽残存的乙醇。将打开管盖的离心管在实验台放置几分钟,让最后残存的痕量乙醇挥发殆尽。不要让 RNA 沉淀干透。
7. 加 50~100 μl DEPC 处理过的水。将 RNA 溶液贮存于 -70℃。
加 SDS 至终浓度 0.5%,然后加热至 65℃ 有助于 RNA 沉淀的溶解。
8. 估计 RNA 的浓度。
来源:丁香实验