亲和柱层析法
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原理
该方法利用mRNA上的寡聚A可与较联寡聚T的纤维素柱在高盐下以碱基配对形式发生亲和吸附,而在低盐下,碱基配对能力破坏,吸附解除,而其他成分的RNA则不具该特性,因此在高盐下当RNA抽提样品流经该柱时,mRNA被挂在柱上,而其他RNA则随高盐溶液流出;当用低盐洗脱液洗柱时,mRNA随洗脱液流出。再用有机溶剂沉淀则可得纯化mRNA。
材料与仪器
mRNA
十二烷基肌氨酸钠 EDTA NaCl Tris-HCl 洗脱液 SDS
十二烷基肌氨酸钠 EDTA NaCl Tris-HCl 洗脱液 SDS
步骤
1. DEPC处理层析柱。
2. 0.1 M NaOH处理Oliga(dT)-纤维素。
3. 用1×上样液洗柱至pH< 8.0。
4. 无菌水溶解RNA,65℃温浴5分钟后,迅速冷却至室温,加等体积2×上样液,上样,分部收集。
5. 1倍体积1×上样液洗柱,分部收集。
6. OD260沉淀收集液,确定收集液的该值是否接近0,如该值仍很大,则上样液继续洗柱,直至该值接近0。
7. 2~3倍柱床体积的洗脱液,洗柱,分部收集。
8. 测定各收集管的OD260,将有吸光值的各管合并。
9. 在洗脱液中加入0.1体积的NaAC,1体积的异丙醇,-20℃沉淀过夜,12 000 g 离心10 min,75%乙醇洗沉淀,真空干燥。
10. 提取mRNA质量的分光光度计检测,将所提mRAN分别在260,280 nm 比色,要求A. OD260%/ OD280%不小于2.0及40 μg 所提样品在OD260%的值为1 。
11. 提取mRNA质量的电泳检测,在1%的变性胶上,EB染色后,mRNA应在0.5-8 Kb 间均匀着色,1.5-2 Kb 间着色较强。
来源:丁香实验